RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 WASHC1A8K0Z3 465 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CAPN14A8MX76 684 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRIM49D1C9J1S8 452 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PGRMC2O15173 223 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TM9SF1O15321 606 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR10H2O60403 315 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMEM127O75204 238 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SEMA3DO95025 777 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZWINTO95229 277 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CLDN9O95484 217 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 AIFM1O95831 613 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 GASTP01350 101 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC35E2P0CK97 266 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 GYPEP15421 78 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CHN1P15882 459 aa4.6□□□□□ -1.67
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TRAPPC8-202ENST00000577426 KRT4P19013 534 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SERPINB3P29508 390 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 NEK2P51955 445 aa4.6□□□□□ -1.67
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TRAPPC8-202ENST00000577426 KCNJ2P63252 427 aa4.6□□□□□ -1.67
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TRAPPC8-202ENST00000577426 PPP2R2BQ00005 443 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 DUSP8Q13202 625 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 LGSNQ5TDP6 509 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRAMEF20Q5VT98 475 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR52E8Q6IFG1 317 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 BHLHB9Q6PI77 547 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SEM1Q6ZVN7 128 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 NUDT13Q86X67 352 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ULK2Q8IYT8 1036 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CLYBLQ8N0X4 340 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TAGAPQ8N103 731 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF615Q8N8J6 731 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 BANPQ8N9N5 519 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR52B6Q8NGF0 335 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 NEIL3Q8TAT5 605 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 DOK4Q8TEW6 326 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 UCN3Q969E3 161 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ADIPOR1Q96A54 375 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF597Q96LX8 424 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 GAL3ST4Q96RP7 486 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SERPINI1Q99574 410 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF559Q9BR84 538 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 NTMT1Q9BV86 223 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CNPPD1Q9BV87 410 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 LDAHQ9H6V9 325 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 WDR41Q9HAD4 459 aa4.6□□□□□ -1.67
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TRAPPC8-202ENST00000577426 ZBTB26Q9HCK0 441 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 B4GALT7Q9UBV7 327 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PCTPQ9UKL6 214 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMCO1Q9UM00 188 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 L3MBTL1Q9Y468 752 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 A0A1W2PPM1 405 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 STX16O14662 325 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CTAG2O75638 210 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 MPDZO75970 2070 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC8-202ENST00000577426 LRATO95237 230 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 GBAP04062 536 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 HPNP05981 417 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 HEXAP06865 529 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 KLK1P06870 262 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CT62P0C5K7 136 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 DHRS4L1P0CG22 281 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 S1PR1P21453 382 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 GDF1P27539 372 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PIK3R1P27986 724 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TYK2P29597 1187 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 MDH1P40925 334 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMED10P49755 219 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CCNG1P51959 295 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 FBXW4P57775 412 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 FUT7Q11130 342 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRAF3Q13114 568 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 MYBPHQ13203 477 aa4.59□□□□□ -1.67
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