RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	C6orf47	O95873	294 aa		19.66	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TGM6	O95932	706 aa		19.66	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	MYZAP	P0CAP1	466 aa		19.66	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	BGN	P21810	368 aa		19.66	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR2DL3	P43628	341 aa		19.66	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC1A6	P48664	564 aa		19.66	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	19.66	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	19.66	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	19.66	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		19.66	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	19.66	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	BTBD2	Q9BX70	525 aa		19.66	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGU	Q9H490	435 aa		19.66	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		19.66	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		19.66	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM221A	A4D161	298 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200		H0YC42	278 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CTAG2	O75638	210 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC73	Q6P1J9	531 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CDH24	Q86UP0	819 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CDS1	Q92903	461 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC46	Q96FV0	321 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP26	Q9BV47	211 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		19.64	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFB5	O43674	189 aa		19.64	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFSF13	O75888	250 aa		19.64	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDN20	P56880	219 aa		19.64	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	HBA1	P69905	142 aa		19.64	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	19.64	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		19.64	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		19.64	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	SFXN5	Q8TD22	340 aa		19.64	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	JADE3	Q92613	823 aa		19.64	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		19.64	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	HHATL	Q9HCP6	504 aa		19.64	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		19.64	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PQD3	144 aa		19.63	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		19.63	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	19.63	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	TP53BP2	Q13625	1128 aa		19.63	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		19.63	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		19.63	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		19.63	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	MEIOB	Q8N635	442 aa		19.63	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	MOAP1	Q96BY2	351 aa		19.63	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		19.63	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		19.63	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD28	O15084	1053 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	GMFG	O60234	142 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFRSF21	O75509	655 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	SORD	Q00796	357 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	BST1	Q10588	318 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	STX3	Q13277	289 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	TESK1	Q15569	626 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	CD226	Q15762	336 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	GATS	Q8NAP1	163 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM222B	Q8WU58	562 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	VDAC3	Q9Y277	283 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	ITPR3	Q14573	2671 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087WZY1	265 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC22A20	A6NK97	555 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BML4	177 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	SCN2B	O60939	215 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	SOX30	O94993	753 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	OCRL	Q01968	901 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	GGN	Q86UU5	652 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF18B	Q86Y91	864 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	MISP	Q8IVT2	679 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	FIG4	Q92562	907 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	NPAS1	Q99742	590 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	NUF2	Q9BZD4	464 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	PNPO	Q9NVS9	261 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PNV4	684 aa		19.6	■□□□□ 0.73
PPP4C-205	ENST00000563200	C7orf72	A4D263	438 aa		19.6	■□□□□ 0.73

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