RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556718.1

PRPF39-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF39, Length 499 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-210ENST00000556718 LANCL3Q6ZV70 420 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF39-210ENST00000556718 C16orf62Q7Z3J2 963 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF39-210ENST00000556718 C10orf67Q8IYJ2 551 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF39-210ENST00000556718 ZNF679Q8IYX0 411 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF39-210ENST00000556718 ZNF683Q8IZ20 524 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF39-210ENST00000556718 FAM133AQ8N9E0 248 aa3.52□□□□□ -1.85
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PRPF39-210ENST00000556718 DNAJA3Q96EY1 480 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF39-210ENST00000556718 SYT11Q9BT88 431 aa3.52□□□□□ -1.85
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PRPF39-210ENST00000556718 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PRPF39-210ENST00000556718 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
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PRPF39-210ENST00000556718 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.5□□□□□ -1.85
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PRPF39-210ENST00000556718 PHC2Q8IXK0 858 aa3.5□□□□□ -1.85
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