RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 TSC22D1Q15714 1073 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 STK11Q15831 433 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 CPTPQ5TA50 214 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 C11orf71Q6IPW1 123 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 P2RY8Q86VZ1 359 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 DEPDC4Q8N2C3 294 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 MUC15Q8N387 334 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 RNF128Q8TEB7 428 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 C10orf105Q8TEF2 133 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 KCTD4Q8WVF5 259 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 SELENOMQ8WWX9 145 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 OSTF1Q92882 214 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 HBEGFQ99075 208 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 DHRS9Q9BPW9 319 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 MCM8Q9UJA3 840 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP10.57□□□□□ -0.728e-11■■■■■ 34.1
CS-228ENST00000551473 GJE1A6NN92 205 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 SHISA8B8ZZ34 492 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 NDUFS8O00217 210 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 KIAA0513O60268 411 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 RAMP1O60894 148 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 PRKD3O94806 890 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 KCNH1O95259 989 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 HSD3B1P14060 373 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 HSD3B2P26439 372 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 EFNA4P52798 201 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 CARD18P57730 90 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 CHRNB3Q05901 458 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 NAB1Q13506 487 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 SGO1Q5FBB7 561 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 TIMM23BQ5SRD1 257 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 TMEM108Q6UXF1 575 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 Q6ZT83 130 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 TRABD2AQ86V40 505 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 KLHL7Q8IXQ5 586 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 OR7G2Q8NG99 324 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 SGMS2Q8NHU3 365 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 ACTRT2Q8TDY3 377 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 KLHL15Q96M94 604 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 TRIM31Q9BZY9 425 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 VPS29Q9UBQ0 182 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 SNX12Q9UMY4 172 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 A0A0J9YW62 118 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 GOLGA8OA6NCC3 632 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 GOLGA8NF8WBI6 632 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 GOLGA8RI6L899 631 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 STX16O14662 325 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 GMFGO60234 142 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 KLHL2O95198 593 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 UTS2O95399 124 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 OTCP00480 354 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 PDYNP01213 254 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 YES1P07947 543 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 IL3P08700 152 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 DHRS4L1P0CG22 281 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 APEHP13798 732 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 PTAFRP25105 342 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 CFPP27918 469 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 EIF1P41567 113 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 GSTM5P46439 218 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 RFX3P48380 749 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 PDLIM4P50479 330 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 TRAF3Q13114 568 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 ZNF544Q6NX49 715 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 SLC22A25Q6T423 547 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 KLHL17Q6TDP4 642 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 Q6ZSR9 355 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 IL17RELQ6ZVW7 336 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 MISPQ8IVT2 679 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 TUSC5Q8IXB3 177 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 SLC43A2Q8N370 569 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 PPM1NQ8N819 430 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 CEP112Q8N8E3 955 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 CDYL2Q8N8U2 506 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 OR4F6Q8NGB9 312 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 ABHD3Q8WU67 409 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 RNF145Q96MT1 663 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 BBS4Q96RK4 519 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-228ENST00000551473 RTN4RQ9BZR6 473 aa10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms