RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547660.5

LETMD1-211, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene LETMD1, Length 601 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-211ENST00000547660 PROM1O43490 865 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 RNF13O43567 381 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ORC5O43913 435 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 OR10H2O60403 315 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 NCR1O76036 304 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 RCBTB2O95199 551 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 NTN1O95631 604 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 EPPINO95925 133 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 IFNGP01579 166 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 CSF2P04141 144 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 DBIP07108 87 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 YES1P07947 543 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 THBS1P07996 1170 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 CSF3P09919 207 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 LIMS3P0CW19 117 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 LIMS4P0CW20 117 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 SAGP10523 405 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 PSKH1P11801 424 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 IFI30P13284 250 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 LAMP2P13473 410 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 MYOGP15173 224 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 BMP7P18075 431 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 CELP19835 753 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 CFL1P23528 166 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 SSTR4P31391 388 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 RCVRNP35243 200 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 CD79BP40259 229 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ACTR1BP42025 376 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 HTR3AP46098 478 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 OMPP47874 163 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 RFX2P48378 723 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 RFX3P48380 749 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 MAN2A2P49641 1150 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ADPRHP54922 357 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 CAV3P56539 151 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 CLDN2P57739 230 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 KIAA1024LP59773 190 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ACTR1AP61163 376 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 BNC1Q01954 994 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ID2Q02363 134 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 HYAL2Q12891 473 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 GPR50Q13585 617 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 FGL2Q14314 439 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 KIR2DS3Q14952 304 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 AGERQ15109 404 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.635e-7■■■□□ 17.5
LETMD1-211ENST00000547660 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ZNF79Q15937 498 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 BAK1Q16611 211 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 DEFB134Q4QY38 66 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 DCST2Q5T1A1 773 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 CCNJQ5T5M9 372 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 IDNKQ5T6J7 187 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 NXNL2Q5VZ03 156 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ZNF425Q6IV72 752 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ARMC6Q6NXE6 501 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 NIPAL3Q6P499 406 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 PLBD1Q6P4A8 553 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 SMARCD3Q6STE5 483 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ARL9Q6T311 187 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ENPP7Q6UWV6 458 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 FRRS1Q6ZNA5 592 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 SPRED2Q7Z698 418 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 MRGPREQ86SM8 312 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 PAQR7Q86WK9 346 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 KLBQ86Z14 1044 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 CPOQ8IVL8 374 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 NKAIN4Q8IVV8 208 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ZNF619Q8N2I2 560 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 Q8N402 240 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 POGLUT1Q8NBL1 392 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 KCT2Q8NC54 265 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 CAMKVQ8NCB2 501 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 BBS1Q8NFJ9 593 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 OR7G2Q8NG99 324 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 OR4F15Q8NGB8 312 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ACOT12Q8WYK0 555 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ARMC5Q96C12 935 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 ART5Q96L15 291 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 WDR92Q96MX6 357 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 SNX18Q96RF0 628 aa4.85□□□□□ -1.63
LETMD1-211ENST00000547660 CD180Q99467 661 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms