RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 PRRC1Q96M27 445 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 IGHG1P01857 330 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 SDHBP21912 280 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 MYF6P23409 242 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 CD83Q01151 205 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 KCNAB2Q13303 367 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 MOGSQ13724 837 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 NIPAL3Q6P499 406 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 Q8N402 240 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 SNAPC3Q92966 411 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 IL17FQ96PD4 163 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00597Q9H2U6 94 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF576Q9H609 170 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 TREM1Q9NP99 234 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 CKAP5Q14008 2032 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 SMCO3A2RU48 225 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 CDHR4A6H8M9 788 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 APOL3O95236 402 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 ALDOBP05062 364 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 RAB3BP20337 219 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 PKLRP30613 574 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 PITPNBP48739 271 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 RGNQ15493 299 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 BIRC8Q96P09 236 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 CHRDQ9H2X0 955 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 NUP50Q9UKX7 468 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 PARP14Q460N5 1801 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 A0A087WUU8 490 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 CLCA1A8K7I4 914 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 SEC14L5O43304 696 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 WDPCPO95876 746 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 SFTPBP07988 381 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 SCD5Q86SK9 330 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 APIPQ96GX9 242 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1W2PPH5 198 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 SGK494L7N484 410 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 LCATP04180 440 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 ACPPP15309 386 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 RAB3AP20336 220 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 CERS1P27544 350 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 GJA5P36382 358 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 ACVR1BP36896 505 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 BNIP3Q12983 259 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 DCST2Q5T1A1 773 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 NAXEQ8NCW5 288 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 RSC1A1Q92681 617 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 MMACHCQ9Y4U1 282 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 SSR4P51571 173 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 FAM78AQ5JUQ0 283 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 SLC6A19Q695T7 634 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 KDELC1Q6UW63 502 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 MMP21Q8N119 569 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 ISOC1Q96CN7 298 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 FIZ1Q96SL8 496 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 OLFM2O95897 454 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 MSX1P28360 303 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-226ENST00000546160 SOX2P48431 317 aa6.03□□□□□ -1.44
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