RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504458.1

SERF1A-204, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, human

TSL 4 BASIC

Gene SERF1A, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1A-204	ENST00000504458	NELL2	Q99435	816 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SRR	Q9GZT4	340 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	WDR26	Q9H7D7	661 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	ASB6	Q9NWX5	421 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	GDE1	Q9NZC3	331 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	RHCG	Q9UBD6	479 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	DUSP13	Q9UII6	198 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	PHF11	Q9UIL8	331 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SNX7	Q9UNH6	387 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	POLH	Q9Y253	713 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	MYO10	Q9HD67	2058 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	CEP250	Q9BV73	2442 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	FEZF1	A0PJY2	475 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	FAM172BP	A6NC97	362 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	IGLON5	A6NGN9	336 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	HMX3	A6NHT5	357 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	CTDSP2	O14595	271 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	PRKY	O43930	277 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	HCN1	O60741	890 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	CYP7B1	O75881	506 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	CCNK	O75909	580 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	UBXN7	O94888	489 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	HLA-DQB1	P01920	261 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	ALPP	P05187	535 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	KRT8	P05787	483 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	EPHX1	P07099	455 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	CHRM4	P08173	479 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	ADRA2A	P08913	450 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	F3	P13726	295 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TNNI3	P19429	210 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	CMPK1	P30085	196 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SDC2	P34741	201 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	HOXD12	P35452	270 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	DRD3	P35462	400 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	DDOST	P39656	456 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	HTR3A	P46098	478 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	MTNR1A	P48039	350 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC6A11	P48066	632 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	METAP1	P53582	386 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	OR2B6	P58173	313 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TAS2R41	P59536	307 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	PPP3R1	P63098	170 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SLAMF1	Q13291	335 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	HTR4	Q13639	388 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SNAPC1	Q16533	368 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	EIPR1	Q53HC9	387 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF425	Q6IV72	752 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	MZT2A	Q6P582	158 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	RRM2B	Q7LG56	351 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	IQCH	Q86VS3	1027 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	NRROS	Q86YC3	692 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC43A2	Q8N370	569 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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