RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 STARP49675 285 aa20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 CLDN18P56856 261 aa20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 MGAT2Q10469 447 aa20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 IL23RQ5VWK5 629 aa20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 AAGABQ6PD74 315 aa20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 PERPQ96FX8 193 aa20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 ITPAQ9BY32 194 aa20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 GSX2Q9BZM3 304 aa20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 UBTD1Q9HAC8 227 aa20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 MIEF1Q9NQG6 463 aa20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 GIMAP4Q9NUV9 329 aa20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 KLHL28Q9NXS3 571 aa20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 TAS2R10Q9NYW0 307 aa20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.89■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 PRAMEF25A6NGN4 478 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 TGM6O95932 706 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 PRPS1L1P21108 318 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 SRD5A2P31213 254 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 CD79BP40259 229 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 C2orf80Q0P641 193 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 PLCXD2Q0VAA5 305 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 MAP4K2Q12851 820 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 PDE7AQ13946 482 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 MAVSQ7Z434 540 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 STARD4Q96DR4 205 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 PIK3IP1Q96FE7 263 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 MARK4Q96L34 752 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 REEP4Q9H6H4 257 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF639Q9UID6 485 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa20.88■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 SLITRK5O94991 958 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 IFI6P09912 130 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 EPHA3P29320 983 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 HPCAL1P37235 193 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 CLDN8P56748 225 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 GSTA3Q16772 222 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 OR2A2Q6IF42 318 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 PLCZ1Q86YW0 608 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 MED18Q9BUE0 208 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 TCF7L2Q9NQB0 619 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 MRGBPQ9NV56 204 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 MAT2BQ9NZL9 334 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 HEY2Q9UBP5 337 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 UTS2RQ9UKP6 389 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 PRR14LQ5THK1 2151 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 ABCA1O95477 2261 aa20.87■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 TO15178 435 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 ATP1B1P05026 303 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 IDO1P14902 403 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 LOXP28300 417 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 CCKARP32238 428 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 AQP5P55064 265 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 BCL2A1Q16548 175 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 DPY19L1Q2PZI1 675 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 FAM111BQ6SJ93 734 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 ERP27Q96DN0 273 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 SFXN2Q96NB2 322 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 BRINP2Q9C0B6 783 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 BCAP29Q9UHQ4 241 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 ATP6V1HQ9UI12 483 aa20.86■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 OR6C70A6NIJ9 312 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 DRD5P21918 477 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 UGT2B10P36537 528 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 PPICP45877 212 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 ALDH9A1P49189 494 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 IDH3AP50213 366 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 VWA1Q6PCB0 445 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 RIMKLAQ8IXN7 391 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 IGFBPL1Q8WX77 278 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 KLHL29Q96CT2 875 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 EGLN2Q96KS0 407 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 PPP1R36Q96LQ0 422 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF681Q96N22 645 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 TSSK3Q96PN8 268 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 ATAD3AQ9NVI7 634 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 AIG1Q9NVV5 245 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 ELOVL5Q9NYP7 299 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 GIMAP2Q9UG22 337 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 FBXL2Q9UKC9 423 aa20.85■□□□□ 0.93
SIMC1-208ENST00000495423 WIF1Q9Y5W5 379 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms