RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 OR4D11Q8NGI4 311 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PTP4A1Q93096 173 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 NXPE3Q969Y0 559 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FCRL4Q96PJ5 515 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 POMT2Q9UKY4 750 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MAFFQ9ULX9 164 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MFSD2BA6NFX1 497 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CASC3O15234 703 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FZD7O75084 574 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 LPLP06858 475 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SULT1A3P0DMM9 295 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SULT1A4P0DMN0 295 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC6A11P48066 632 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SMIM11AP58511 58 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 DGCR2P98153 550 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 IKZF1Q13422 519 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC27A4Q6P1M0 643 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 OAFQ86UD1 273 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 HORMAD2Q8N7B1 307 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RADILQ96JH8 1075 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC38A2Q96QD8 506 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 LDAHQ9H6V9 325 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 BRF2Q9HAW0 419 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 HPF1Q9NWY4 346 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 IRGMA1A4Y4 181 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CHST10O43529 356 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC28A2O43868 658 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 KCNJ13O60928 360 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 HSD3B1P14060 373 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 EPCAMP16422 314 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MED27Q6P2C8 311 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 REG4Q9BYZ8 158 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CKAP5Q14008 2032 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ANHXE9PGG2 379 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 EFCAB14O75071 495 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RAB3AP20336 220 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZP1P60852 638 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 NHLRC3Q5JS37 347 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ATRAIDQ6UW56 229 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RRM2BQ7LG56 351 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PRSS45Q7RTY3 260 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF547Q8IVP9 402 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 OR10A4Q9H209 315 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 GLS2Q9UI32 602 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF98A6NK75 572 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PGRMC2O15173 223 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 LILRB5O75023 590 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FURINP09958 794 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 C21orf58P58505 322 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 DSG2Q14126 1118 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC36A2Q495M3 483 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 HBMQ6B0K9 141 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PYHIN1Q6K0P9 492 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ARL9Q6T311 187 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TFAP2EQ6VUC0 442 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CAMKMTQ7Z624 323 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 HMGB4Q8WW32 186 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 XAGE5Q8WWM1 108 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 GSDMCQ9BYG8 508 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC6A16Q9GZN6 736 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CXorf36Q9H7Y0 433 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF304Q9HCX3 659 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CNIH4Q9P003 139 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 COPZ2Q9P299 210 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TSPAN11A1L157 253 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SOX30O94993 753 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CEBPBP17676 345 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 GAS1P54826 345 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MANFP55145 182 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 HSPB3Q12988 150 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MINDY4Q4G0A6 757 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC30A6Q6NXT4 461 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 IZUMO1Q8IYV9 350 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 HERVK_113Q902F9 699 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TIFAQ96CG3 184 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TMEM168Q9H0V1 697 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MGAT4CQ9UBM8 478 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ALPK3Q96L96 1907 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PPK0 400 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PRRT4C9JH25 899 aa12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.8 ms