RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 MAPK11Q15759 364 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 LIN52Q52LA3 116 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 EIPR1Q53HC9 387 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 TBCELQ5QJ74 424 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 LYPD8Q6UX82 237 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FRRS1Q6ZNA5 592 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FAM26EQ8N5C1 309 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 RNF148Q8N7C7 305 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SLC26A7Q8TE54 656 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 TM9SF4Q92544 642 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FIG4Q92562 907 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FAM162AQ96A26 154 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 DTNBP1Q96EV8 351 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SDHAF3Q9NRP4 125 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 HPF1Q9NWY4 346 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 BAG5Q9UL15 447 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CACNA1DQ01668 2161 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 M0QX08 132 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SYT5O00445 386 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SCDO00767 359 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 MFN2O95140 757 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 UTS2O95399 124 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CELA2AP08217 269 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 DCTP40126 519 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CYB561P49447 251 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 KCNJ2P63252 427 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SELENOWP63302 87 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CHRNEQ04844 493 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 RNF220Q5VTB9 566 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 C1orf146Q5VVC0 180 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FIGNL1Q6PIW4 674 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 IGFL2Q6UWQ7 119 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 RTL4Q6ZR62 310 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CBLL1Q75N03 491 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ARMC8Q8IUR7 673 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SIRT6Q8N6T7 355 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 OR4N2Q8NGD1 307 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 RNF138Q8WVD3 245 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 HAS2Q92819 552 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CLPTM1LQ96KA5 538 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ADOQ96SZ5 270 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 PINK1Q9BXM7 581 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 RUBCNLQ9H714 662 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 KLHL28Q9NXS3 571 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 GPR83Q9NYM4 423 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SEC14L3Q9UDX4 400 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 EGFL7Q9UHF1 273 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ANAPC2Q9UJX6 822 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 MKLN1Q9UL63 735 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 DTNAQ9Y4J8 743 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CCDC88CQ9P219 2028 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ALG1L2C9J202 215 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 MKRN2OSH3BPM6 223 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FCMRO60667 390 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 NME6O75414 186 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 UGT2B17O75795 530 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 DNAJB5O75953 348 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 IGKV1D-16P01601 117 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 GPIP06744 558 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CYP4B1P13584 511 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 NID1P14543 1247 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 IL7RP16871 459 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SOX3P41225 446 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 KCNJ5P48544 419 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CCL11P51671 97 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 MS4A2Q01362 244 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 GPR68Q15743 365 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 NNATQ16517 81 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 KLHL26Q53HC5 615 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ZNF311Q5JNZ3 666 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CCNJQ5T5M9 372 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SLC30A6Q6NXT4 461 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 ZNF440Q8IYI8 595 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 FAM156AQ8NDB6 213 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 OR52P1PQ8NH57 321 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 PAQR8Q8TEZ7 354 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 WDR60Q8WVS4 1066 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 HGDQ93099 445 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
NISCH-211ENST00000488243 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms