RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449082.2

SCN10A-201, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCN10A, Length 6,418 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10A-201ENST00000449082 ACTL6BO94805 426 aa9.6□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 HTR3BO95264 441 aa9.6□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 CPMP14384 443 aa9.6□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 HLCSP50747 726 aa9.6□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.6□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 PAQR9Q6ZVX9 377 aa9.6□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 IQCF1Q8N6M8 205 aa9.6□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 SYT4Q9H2B2 425 aa9.6□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 CHRDQ9H2X0 955 aa9.6□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.6□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 ZNF226Q9NYT6 803 aa9.6□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.6□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.6□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 TAS2R8Q9NYW2 309 aa9.6□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.6□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 FBP2O00757 339 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 CSF2P04141 144 aa9.59□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 ABOP16442 354 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 PSMB5P28074 263 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 UQCRC1P31930 480 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 PSPHP78330 225 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 STK11Q15831 433 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 PNPLA1Q8N8W4 532 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 ARRDC3Q96B67 414 aa9.59□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 PRRC1Q96M27 445 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 KLHL13Q9P2N7 655 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 F5H5K5 113 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 SLC2A5P22732 501 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 ERP29P30040 261 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 RAB38P57729 211 aa9.59□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 ZNF181Q2M3W8 571 aa9.59□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 CAMK2AQ9UQM7 478 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 H0YGG7 62 aa9.59□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 UGT2B7P16662 529 aa9.59□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 OR51Q1Q8NH59 317 aa9.59□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 OR7D2Q96RA2 312 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 OR10A5Q9H207 317 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 OR10A2Q9H208 303 aa9.59□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.59□□□□□ -0.87
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SCN10A-201ENST00000449082 RTP3Q9BQQ7 232 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 HCAR1Q9BXC0 346 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 GPR160Q9UJ42 338 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 CCL26Q9Y258 94 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 MAP2K3P46734 347 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 ACTBP60709 375 aa9.59□□□□□ -0.87
SCN10A-201ENST00000449082 ACTG1P63261 375 aa9.59□□□□□ -0.87
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