RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 TBL1YQ9BQ87 522 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 CDCP1Q9H5V8 836 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 MED9Q9NWA0 146 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 CD109Q6YHK3 1445 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 EFSO43281 561 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 IFNA5P01569 189 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 USF1P22415 310 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 IVDP26440 423 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 CCKARP32238 428 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SREBF1P36956 1147 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 AVPR1BP47901 424 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 RIPPLY3P57055 190 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 MFSD10Q14728 455 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SPHARQ15513 63 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SAXO2Q658L1 398 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 MED27Q6P2C8 311 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM40Q6P9F5 258 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 GDPD4Q6W3E5 623 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 FRRS1Q6ZNA5 592 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 DPY19L4Q7Z388 723 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 GRINAQ7Z429 371 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SPPL2BQ8TCT7 592 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 PXYLP1Q8TE99 480 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 BORCS7Q96B45 105 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC58Q96CX6 371 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM169Q96HH4 297 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 MCEEQ96PE7 176 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 PNMA5Q96PV4 448 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 EPYCQ99645 322 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 GPR88Q9GZN0 384 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 LANCL2Q9NS86 450 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 PPP5D1E7EU14 171 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 NFKBIEO00221 500 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 DPYSL4O14531 572 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 DOK2O60496 412 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 MTHFD2P13995 350 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 PGAM1P18669 254 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 TBPP20226 339 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 EPHA1P21709 976 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 OR10J1P30954 320 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 DAOAP59103 153 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 IL13RA1P78552 427 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 BAXQ07812 192 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 CARD17Q5XLA6 110 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 KCTD11Q693B1 232 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 IL27RAQ6UWB1 636 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 KCTD9Q7L273 389 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHH3Q7Z736 793 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 FAM71AQ8IYT1 594 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 OR6V1Q8N148 313 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SLC35F5Q8WV83 523 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 TFAP2BQ92481 460 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF226Q9NYT6 803 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SLC17A6Q9P2U8 582 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 AK3Q9UIJ7 227 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 UNC119BA6NIH7 251 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 PIRO00625 290 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD28O15084 1053 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SUV39H1O43463 412 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 GRIN3BO60391 1043 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SEMA4FO95754 770 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 FBLN1P23142 703 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 TACR3P29371 465 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 IL12BP29460 328 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 IFNGR2P38484 337 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 GTF2A2P52657 109 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 PROX2Q3B8N5 592 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 FDX2Q6P4F2 183 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM270Q6UE05 265 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 MFSD7Q6UXD7 560 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SLC44A5Q8NCS7 719 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 HASPINQ8TF76 798 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 MITD1Q8WV92 249 aa5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms