RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 C4AP0C0L4 1744 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM227AF5H4B4 570 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ARAFP10398 606 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 MMP12P39900 470 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 HTR3AP46098 478 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CXCR4P61073 352 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 DCAF7P61962 342 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 HBA1P69905 142 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 RAB40BQ12829 278 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 HDAC8Q9BY41 377 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 OBP2AQ9NY56 170 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 GGT3PA6NGU5 568 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 LHCGRP22888 699 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PRR22Q8IZ63 422 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 IL37Q9NZH6 218 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ITGAMP11215 1152 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 RDH8Q9NYR8 311 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF806P0C7X5 589 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 STT3AP46977 705 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PRKXP51817 358 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 GLO1Q04760 184 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM205BPQ63HN1 556 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 POLE4Q9NR33 117 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SYT7O43581 403 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 OR7A10O76100 309 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SFTPDP35247 375 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SGSHP51688 502 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 GNMTQ14749 295 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SPTSSAQ969W0 71 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 MRI1Q9BV20 369 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CBLCQ9ULV8 474 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 H3BML4 177 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TSPAN4O14817 238 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 RP2O75695 350 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PLATP00750 562 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TAP2Q03519 686 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC22A10Q63ZE4 541 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 LSMEM2Q8N112 164 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 FNDC8Q8TC99 324 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TCTN2Q96GX1 697 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 UBQLN4Q9NRR5 601 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 NPIPA7E9PJI5 369 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 H0YGG7 62 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 M0R129 80 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SFTPBP07988 381 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 NPIPA8P0DM63 369 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 BEND4Q6ZU67 534 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF595Q8IYB9 648 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF611Q8N823 705 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF709Q8N972 641 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 OR5J2Q8NH18 312 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 GPR148Q8TDV2 347 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 OR5B2Q96R09 309 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 MYADMQ96S97 322 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ADOQ96SZ5 270 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms