RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 PON3Q15166 354 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 CCNJQ5T5M9 372 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 IL23RQ5VWK5 629 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 WDR93Q6P2C0 686 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 AP4B1Q9Y6B7 739 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 AKAP6Q13023 2319 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 FAM221AA4D161 298 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 CASKO14936 926 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 TNFRSF21O75509 655 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 LAMP1P11279 417 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 ATP6V1C1P21283 382 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 MAP3K8P41279 467 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 TP53BP2Q13625 1128 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 MLC1Q15049 377 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 POU4F3Q15319 338 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 C6orf136Q5SQH8 315 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 VWA1Q6PCB0 445 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 NUDCD3Q8IVD9 361 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 OR4C3Q8NH37 302 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 FNDC9Q8TBE3 224 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 CDS1Q92903 461 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 C3orf30Q96M34 536 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 PRRG4Q9BZD6 226 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 UBQLN4Q9NRR5 601 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 NDRG3Q9UGV2 375 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF175Q9Y473 711 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 PCNX3Q9H6A9 2034 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 MED13LQ71F56 2210 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-202ENST00000378546 A8MXE2 369 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 MSTNO14793 375 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 CFLARO15519 480 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 NGFRP08138 427 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 FCGR2AP12318 317 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 TBXA2RP21731 343 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 ARRB2P32121 409 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 CLDN15P56746 228 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 ZAR1Q86SH2 424 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 DACH2Q96NX9 599 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 FOXC2Q99958 501 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 BTBD2Q9BX70 525 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 HIVEP1P15822 2718 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 A0A087WZY1 265 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 WDR91A4D1P6 747 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 TYROBPO43914 113 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 C6orf47O95873 294 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF17P17021 662 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 LCN1P31025 176 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 SOAT1P35610 550 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 KCNJ5P48544 419 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 MISPQ8IVT2 679 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 NATD1Q8N6N6 113 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 OR56A1Q8NGH5 318 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 OR5P2Q8WZ92 322 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 PGM2Q96G03 612 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 STACQ99469 402 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 CENPHQ9H3R5 247 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 GOSR1O95249 250 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 KRT16P08779 473 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 CCT3P49368 545 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 FGFBP1Q14512 234 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 PAMR1Q6UXH9 720 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 METTL25Q8N6Q8 603 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 FAM110BQ8TC76 370 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 ADAMTS15Q8TE58 950 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 STARD4Q96DR4 205 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 NEUROD4Q9HD90 331 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 DUSP22Q9NRW4 184 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 FBXO34Q9NWN3 711 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 GIN1Q9NXP7 522 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 PLGP00747 810 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 PRPS1L1P21108 318 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 ME2P23368 584 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-202ENST00000378546 RIPPLY3P57055 190 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms