RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 M1APQ8TC57 530 aa16.36■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 TP53INP1Q96A56 240 aa16.36■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 KLHL4Q9C0H6 718 aa16.36■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 COQ10BQ9H8M1 238 aa16.36■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 MMP25Q9NPA2 562 aa16.36■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa16.36■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 UGT2B11O75310 529 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 SEMA7AO75326 666 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 CYP7B1O75881 506 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 DXOO77932 396 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 PRG2P13727 222 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 ITGA2P17301 1181 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 CDH12P55289 794 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 RTP5Q14D33 572 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 IZUMO2Q6UXV1 221 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 TAGAPQ8N103 731 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 OR52J3Q8NH60 311 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 PIP5K1AQ99755 562 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 MYOTQ9UBF9 498 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 SOCS2O14508 198 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 HS6ST1O60243 411 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 PRSS23O95084 383 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 GUSBP08236 651 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 HPGDP15428 266 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 GCKP35557 465 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 FBXW4P57775 412 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 RNF220Q5VTB9 566 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 TBPL2Q6SJ96 375 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 CBR4Q8N4T8 237 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 PMM1Q92871 262 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 NXPE2Q96DL1 559 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 SLC29A1Q99808 456 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 REEP1Q9H902 201 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 UBQLN4Q9NRR5 601 aa16.35■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 CDHR4A6H8M9 788 aa16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 SERINC4A6NH21 518 aa16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 C17orf51A8MQB3 221 aa16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 SCDO00767 359 aa16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 FFAR1O14842 300 aa16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 PPM1BO75688 479 aa16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 DNAJB5O75953 348 aa16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 SDHBP21912 280 aa16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 FGFBP1Q14512 234 aa16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 CD226Q15762 336 aa16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 APOOLQ6UXV4 268 aa16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 ZNF347Q96SE7 839 aa16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 OIP5O43482 229 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 SCO2O43819 266 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 TPST2O60704 377 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 CSTAP01040 98 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 RHCEP18577 417 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 PRKACGP22612 351 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 AQP4P55087 323 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 AP1ARQ63HQ0 302 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD34AQ69YU3 496 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 STK32CQ86UX6 486 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 CYP4Z1Q86W10 505 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 SIRT6Q8N6T7 355 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 ZNF527Q8NB42 609 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 SLC22A8Q8TCC7 542 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 RASL10BQ96S79 203 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 HOXD1Q9GZZ0 328 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 VCX3BQ9H321 246 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 CDCP1Q9H5V8 836 aa16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 TNFRSF11BO00300 401 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 EI24O14681 340 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 GMFGO60234 142 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ITGA10O75578 1167 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ZNF136P52737 540 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 PNLIPRP2P54317 469 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 KLHL26Q53HC5 615 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 FGD3Q5JSP0 725 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 MARCH3Q86UD3 253 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 OR5K1Q8NHB7 308 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 MCHR1Q99705 422 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 C9orf16Q9BUW7 83 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 RTN4RQ9BZR6 473 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 ARMC7Q9H6L4 198 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa16.33■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa16.32■□□□□ 0.2
LTV1-201ENST00000367576 G3V2T6 193 aa16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms