RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 FBLP22087 321 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 GALNSP34059 522 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 EFNA3P52797 238 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 GINS1Q14691 196 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 OR1Q1Q15612 314 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 CT45A2Q5DJT8 189 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 VWA2Q5GFL6 755 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 RRM2BQ7LG56 351 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ZNF614Q8N883 585 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 PIGXQ8TBF5 258 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 RORBQ92753 470 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 OR1F2PQ96R84 312 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 EGLN3Q9H6Z9 239 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ACOT13Q9NPJ3 140 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 CLN6Q9NWW5 311 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 MMACHCQ9Y4U1 282 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 MPZL2O60487 215 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 GSTM3P21266 225 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 IFNGR2P38484 337 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 DSG2Q14126 1118 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ACSM5Q6NUN0 579 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 TMEM151BQ8IW70 566 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 PRSS58Q8IYP2 241 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 SVOPQ8N4V2 548 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 MYDGFQ969H8 173 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 PRSS27Q9BQR3 290 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 Q9N2J8 555 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 TVP23BQ9NYZ1 205 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ENTPD6O75354 484 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 CDK1P06493 297 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 STSP08842 583 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 MSL3P1P0C860 447 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 DRD5P21918 477 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 GIPRP48546 466 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 TMBIM6P55061 237 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 TSPAN31Q12999 210 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 BIKQ13323 160 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 CASP12Q6UXS9 341 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 MED25Q71SY5 747 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 NRMQ8IXM6 262 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 BCORP1Q8N888 145 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 B3GNT7Q8NFL0 401 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 FKBP10Q96AY3 582 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 PHOX2BQ99453 314 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 FUNDC2Q9BWH2 189 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 CBLCQ9ULV8 474 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GX78 115 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 TRAPPC13A5PLN9 417 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 LYPD3O95274 346 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 LCKP06239 509 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 GUSBP08236 651 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 GPR4P46093 362 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 RHAGQ02094 409 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ARHGAP40Q5TG30 622 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 WDR88Q6ZMY6 472 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 QSOX2Q6ZRP7 698 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 TCEANCQ8N8B7 351 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ARMC7Q9H6L4 198 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 OR10H1Q9Y4A9 318 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 NR4A1P22736 598 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ACVR2AP27037 513 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 CDK5Q00535 292 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ST3GAL4Q11206 333 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 SQSTM1Q13501 440 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 LAPTM4BQ86VI4 370 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 TMEM105Q8N8V8 129 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 OR7G1Q8NGA0 311 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 OR8D4Q8NGM9 314 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 RNF217Q8TC41 542 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 LMF1Q96S06 567 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 PRODH2Q9UF12 536 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 SH3D21A4FU49 640 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 PRKYO43930 277 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 NOL3O60936 208 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ADRA2AP08913 450 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 PSMB9P28065 219 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 SLC37A1P57057 533 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ZNF141Q15928 474 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 STX19Q8N4C7 294 aa16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms