RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ONECUT2O95948 504 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MPLP40238 635 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GSSP48637 474 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NSDHLQ15738 373 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDZK1Q5T2W1 519 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XAF1Q6GPH4 301 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCORP1Q8N888 145 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC2A12Q8TD20 617 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF721Q8TF20 911 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OIT3Q8WWZ8 545 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ART5Q96L15 291 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C14orf105Q9NVL8 296 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IMPAD1Q9NX62 359 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF226Q9NYT6 803 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTSFQ9UBX1 484 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NTNG1Q9Y2I2 539 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR10H1Q9Y4A9 318 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYO15AQ9UKN7 3530 aa20.22■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRAPPC13A5PLN9 417 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ENO4A6NNW6 628 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 D6RAR5 112 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HBQ1P09105 142 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRG2P13727 222 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HTR2AP28223 471 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPICP45877 212 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PMS2P3Q13401 168 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LPAL2Q16609 132 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLX4IPQ5VYV7 408 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF730Q6ZMV8 503 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 P3H2Q8IVL5 708 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NLGN4XQ8N0W4 816 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MKL2Q9ULH7 1088 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTGES3LE9PB15 166 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCRG1O75711 98 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TIAF1O95411 115 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATXN8OSP0DMR3 200 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AVPR2P30518 371 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RFX3P48380 749 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP12AP54707 1039 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGFBP1Q14512 234 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NKAIN4Q8IVV8 208 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC103Q8IW40 242 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CMIPQ8IY22 773 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC38A9Q8NBW4 561 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZFAND2BQ8WV99 257 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR8D2Q9GZM6 311 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNX5Q9Y5X3 404 aa20.21■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM20BO75063 409 aa20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OMPP47874 163 aa20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSPAN31Q12999 210 aa20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LSAMPQ13449 338 aa20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAB39AQ14964 217 aa20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C12orf73Q69YU5 71 aa20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DBX2Q6ZNG2 339 aa20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LAPTM4BQ86VI4 370 aa20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF321PQ8N8H1 164 aa20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIGXQ8TBF5 258 aa20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPA33Q99795 319 aa20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF559Q9BR84 538 aa20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC7A7Q9UM01 511 aa20.2■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FRG2CA6NGY1 282 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A8MUA0 341 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SOX14O95416 240 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GKN3PP0CG01 181 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POU1F1P28069 291 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRK6P43250 576 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR1Q1Q15612 314 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEDD8Q15843 81 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NNATQ16517 81 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHF19Q5T6S3 580 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM236Q5W0B7 351 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF613Q6PF04 617 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RRM2BQ7LG56 351 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R3BQ86XI6 285 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STT3BQ8TCJ2 826 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIGLEC11Q96RL6 698 aa20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 H3BN98 237 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms