RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260054.8

CCDC90B-201, Transcript of coiled-coil domain containing 90B, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC90B, Length 1,688 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90B-201ENST00000260054 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 HAS2Q92819 552 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 DTNAQ9Y4J8 743 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 ALG1L2C9J202 215 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 SCDO00767 359 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CDK2AP1O14519 115 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 TPST1O60507 370 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 SERPINB7O75635 380 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 PDGFAP04085 211 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 DBIP07108 87 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 NID1P14543 1247 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 HPGDP15428 266 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 IL7RP16871 459 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 PTGDSP41222 190 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CASP3P42574 277 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 ARG2P78540 354 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 PLAURQ03405 335 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 FLOT2Q14254 428 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 OR1C1Q15619 314 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CD226Q15762 336 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 DUSP7Q16829 419 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CYBRD1Q53TN4 286 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 ZNF311Q5JNZ3 666 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 ZNF836Q6ZNA1 936 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 MARCH3Q86UD3 253 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 COMTD1Q86VU5 262 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 GATSQ8NAP1 163 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 ZNF527Q8NB42 609 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 MDS2Q8NDY4 140 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 WDR60Q8WVS4 1066 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 IFT52Q9Y366 437 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 ATMQ13315 3056 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CFAP73A6NFT4 308 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 SERINC4A6NH21 518 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 C17orf51A8MQB3 221 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 K7EM74 188 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 SCO2O43819 266 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 EPPINO95925 133 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 THBS1P07996 1170 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CD247P20963 164 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CD97P48960 835 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 ERFP50548 548 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 FGFBP1Q14512 234 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 LINC00303Q3SY05 128 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 LIN52Q52LA3 116 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 C1orf146Q5VVC0 180 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 SLC22A10Q63ZE4 541 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CBLL1Q75N03 491 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 PSD4Q8NDX1 1056 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 PROK2Q9HC23 129 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 KLRF1Q9NZS2 232 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 A0A1W2PQD3 144 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 TCRBV5S2A0A599 114 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 C2orf72A6NCS6 295 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 SLC25A12O75746 678 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CIB2O75838 187 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 IFNA14P01570 189 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 PRKAR1BP31321 381 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 KCNJ5P48544 419 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 GAS1P54826 345 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 KCNJ10P78508 379 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 CLIP4Q8N3C7 705 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC90B-201ENST00000260054 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms