RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040111.9

Ttc28-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Ttc28, Length 10,780 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Cep295Q8BQ48 2412 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm5938A2AEN9 163 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Prdm14E9Q3T6 561 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 FaimlJ3QPY3 178 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Apoc1P34928 88 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Tie1Q06806 1134 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 UradQ283N4 178 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 PeloQ80X73 385 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Fam155aQ8CCS2 467 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 D8Ertd738eQ8R1F0 94 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 GlyatQ91XE0 296 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Scpep1Q920A5 452 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Fgf22Q9ESS2 162 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Spint1Q9R097 507 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Sptan1P16546 2472 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ncor2Q9WU42 2472 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Btbd2E9PUS2 523 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Zfp599E9PWP1 548 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm3072F6SKY8 209 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm17654F7AXR3 209 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Rfx3P48381 749 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Apobec1P51908 229 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 AdprhP54923 362 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 MedagQ14BA6 303 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Cobll1Q3UMF0 1273 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Olfr885Q7TRE0 309 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 GalpQ810H5 117 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ppp1r1cQ8BKK4 108 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gpat4Q8K2C8 456 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Fuca1Q99LJ1 452 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 MynnQ99MD8 610 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 PyurfQ9D1C3 112 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Entpd4Q9DBT4 613 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Rgs20Q9QZB1 239 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gtf3c1Q8K284 2101 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Zfp982A2A8Q4 368 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 CerklA2AQH1 525 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Zfp81B8JJZ7 531 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Galnt1O08912 559 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 HckP08103 524 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Jmjd7P0C872 316 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Adam20Q7M763 760 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Synpo2lQ8BWB1 975 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Srfbp1Q9CZ91 441 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ift43Q9DA69 206 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 P33monoxQ9DBN4 303 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Olfr1156A2AVC3 323 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Olfr618K7N6B3 318 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Csf1P07141 552 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Vamp3P63024 103 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Sez6l2Q4V9Z5 910 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Itih5Q8BJD1 952 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 AntxrlQ8BVM2 641 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Cdc123Q8CII2 336 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Wdr74Q8VCG3 384 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Olfr691Q8VGW5 322 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Wasf3Q8VHI6 501 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Sult5a1Q91X36 291 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Rcbtb2Q99LJ7 551 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Nprl2Q9WUE4 380 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Sned1Q70E20 1403 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Zfp708F8VPP0 541 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm3633L7N233 213 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Vmn1r31L7N2F1 303 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm9611L7N476 213 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ighg1P01869 393 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 CryaaP24622 196 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gabarapl2P60521 117 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gfod1Q3UHD2 390 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Snrnp70Q62376 448 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Alg8Q6P8H8 526 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Nadsyn1Q711T7 725 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Rbm45Q8BHN5 476 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Fastkd3Q8BSN9 661 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Med19Q8C1S0 244 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Olfr692Q8VF03 329 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 AireQ9Z0E3 552 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Rhox2cA2AWL9 191 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Cd93O89103 644 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 P03987 398 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 CpoxP36552 443 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Clec18aQ7TSQ1 534 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Coro2bQ8BH44 480 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Angptl7Q8R1Q3 337 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Bbox1Q924Y0 387 aa8.32□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Dcaf4A0A1Y7VNZ0 532 aa8.31□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Esp15A8R0U8 85 aa8.31□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm8765B7ZWJ3 1017 aa8.31□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm906Q3V0M1 1017 aa8.31□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Spock1Q62288 442 aa8.31□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Pomt2Q8BGQ4 820 aa8.31□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Mon1bQ8BMQ8 553 aa8.31□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Zbtb20Q8K0L9 741 aa8.31□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Etfrf1Q91V16 86 aa8.31□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Actl6bQ99MR0 426 aa8.31□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 TrirQ9D735 173 aa8.31□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Slc38a3Q9DCP2 505 aa8.31□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa8.31□□□□□ -1.08
Ttc28-201ENSMUST00000040111 RfngO09009 332 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.4 ms