RNA–Protein interactions for RNA: YFR032C

RRT5, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene RRT5, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRT5	YFR032C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	RFC5	P38251	354 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	ERC1	P38767	581 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	PEX1	P24004	1043 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	HMT1	P38074	348 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	RIM4	P38741	713 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	YER186C	P40101	306 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	YDR344C	Q05510	147 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	ZPS1	Q12512	249 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	FMP27	Q06179	2628 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	FOB1	O13329	566 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	YSC83	P32792	385 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	MNR2	P35724	969 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	UBP13	P38187	747 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	MMS4	P38257	691 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	BFA1	P47113	574 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	VTC3	Q02725	835 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	TRS130	Q03660	1102 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	PLP2	Q12017	286 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	OSH2	Q12451	1283 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	PTC5	Q12511	572 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRT5	YFR032C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.7	□□□□□ -0.54	not detected
RRT5	YFR032C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	PET10	P36139	283 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	MGA2	P40578	1113 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	THI6	P41835	540 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	UBA2	P52488	636 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	NUT1	P53114	1132 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	GUP1	P53154	560 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	ENV11	P53246	860 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	SEC5	P89102	971 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	CUR1	Q06469	252 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	YPL150W	Q12152	901 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	SPE1	P08432	466 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	HMG2	P12684	1045 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	DAK2	P43550	591 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	TAM41	P53230	385 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	EEB1	Q02891	456 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	REC8	Q12188	680 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	CIT2	P08679	460 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.68	□□□□□ -0.54	not detected
RRT5	YFR032C	TOF1	P53840	1238 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	CCH1	P50077	2039 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	MAS1	P10507	462 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	PCK1	P10963	549 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	PEX2	P32800	271 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	TRM2	P33753	639 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	SHS1	Q07657	551 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	PGS1	P25578	521 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	PRR1	P28708	518 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	MNN4	P36044	1178 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	HXT5	P38695	592 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	LSB6	P42951	607 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	YKL097C	P34245	136 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	ORC5	P50874	479 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RRT5	YFR032C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	RAM1	P22007	431 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	ULI1	P43604	169 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	STB4	P50104	949 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	SPC98	P53540	846 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	STP1	Q00947	519 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	ADA2	Q02336	434 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	PML39	Q03760	334 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	TAF13	P11747	167 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	RGP1	P16664	663 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	VPS3	P23643	1011 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	COY1	P34237	679 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	RGD1	P38339	666 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	ARP1	P38696	384 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	YTA12	P40341	825 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	VTC2	P43585	828 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	YPL277C	Q08989	487 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	MAL33	P38157	468 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RRT5	YFR032C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55

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