RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	POLI	Q9UNA4	740 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	ERCC3	P19447	782 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	TMC7	Q7Z402	723 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	GPR152	Q8TDT2	470 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	CEP63	Q96MT8	703 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	BRD7	Q9NPI1	651 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175		H3BM21	787 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	BNIP3L	O60238	219 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	EGFR	P00533	1210 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	EPB42	P16452	691 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	USP5	P45974	858 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	STRN4	Q9NRL3	753 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	GPR182	O15218	404 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	VSIG8	P0DPA2	414 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	AAMP	Q13685	434 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	FAM182B	Q5T319	152 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	XKR5	Q6UX68	686 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	SV2A	Q7L0J3	742 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	USP20	Q9Y2K6	914 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATRX-223	ENST00000637175	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	TREH	O43280	583 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	5.46	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	EHHADH	Q08426	723 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	PDE3B	Q13370	1112 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	DSC3	Q14574	896 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	COL19A1	Q14993	1142 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF787	Q6DD87	383 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	MARK1	Q9P0L2	795 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	PHF24	Q9UPV7	400 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	CDC14C	A4D256	554 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	PCSK2	P16519	638 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	FGFR3	P22607	806 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	GAS6	Q14393	721 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	GSX2	Q9BZM3	304 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175		A6NHS1	94 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	GPR25	O00155	361 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	XYLB	O75191	536 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	VEGFB	P49765	207 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	GRIN2C	Q14957	1233 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	EFCC1	Q9HA90	598 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	CD33	P20138	364 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	SPEM2	Q0P670	501 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	CCIN	Q13939	588 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	NLRP13	Q86W25	1043 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	SLC30A3	Q99726	388 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	C2CD2L	O14523	706 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	TNFRSF21	O75509	655 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	CTBS	Q01459	385 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	C8orf34	Q49A92	452 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	CHRD	Q9H2X0	955 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	ELP3	Q9H9T3	547 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	ZFAT	Q9P243	1243 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	ERBB4	Q15303	1308 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	MAP3K6	O95382	1288 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	TMC1	Q8TDI8	760 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATRX-223	ENST00000637175	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54

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