RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622457.1

LTBP4-238, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-238	ENST00000622457	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		15.28	■□□□□ 0.04
LTBP4-238	ENST00000622457	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		15.28	■□□□□ 0.04
LTBP4-238	ENST00000622457	WDR63	Q8IWG1	891 aa		15.28	■□□□□ 0.04
LTBP4-238	ENST00000622457	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		15.28	■□□□□ 0.04
LTBP4-238	ENST00000622457	PROSER3	Q2NL68	480 aa		15.27	■□□□□ 0.04
LTBP4-238	ENST00000622457	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		15.27	■□□□□ 0.04
LTBP4-238	ENST00000622457	CNBD1	Q8NA66	436 aa		15.27	■□□□□ 0.04
LTBP4-238	ENST00000622457	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
LTBP4-238	ENST00000622457	LAMB2	P55268	1798 aa		15.26	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		15.26	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	ST5	P78524	1137 aa		15.26	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	HLF	Q16534	295 aa		15.26	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		15.26	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		15.26	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	TSKS	Q9UJT2	592 aa		15.26	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	15.26	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	LTBP1	Q14766	1721 aa		15.26	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		15.25	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	PDE6B	P35913	854 aa		15.25	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	ZNF521	Q96K83	1311 aa		15.24	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	NYX	Q9GZU5	481 aa		15.24	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		15.24	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	HYPK	Q9NX55	129 aa		15.24	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		15.23	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		15.23	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		15.23	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	ANXA1	P04083	346 aa		15.23	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	PARP10	Q53GL7	1025 aa		15.23	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		15.23	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		15.23	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	COPS6	Q7L5N1	327 aa		15.23	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		15.23	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		15.23	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	NECTIN2	Q92692	538 aa		15.23	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	SCN4A	P35499	1836 aa		15.22	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	SLX4	Q8IY92	1834 aa		15.22	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457		H0YIN7	160 aa		15.22	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	NPHP1	O15259	732 aa		15.22	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	15.22	■□□□□ 0.03	3e-12	■■■■■ 31.4
LTBP4-238	ENST00000622457	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		15.22	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		15.22	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		15.21	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		15.21	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		15.21	■□□□□ 0.03
LTBP4-238	ENST00000622457	NTSR2	O95665	410 aa		15.2	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	TSPYL6	Q8N831	410 aa		15.2	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	TTLL6	Q8N841	843 aa		15.2	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		15.2	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	ABCC12	Q96J65	1359 aa		15.2	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	SRGN	P10124	158 aa		15.19	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	STYK1	Q6J9G0	422 aa		15.19	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		15.19	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		15.19	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	RASSF10	A6NK89	507 aa		15.18	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	GPT	P24298	496 aa		15.18	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	GOLGA2	Q08379	1002 aa		15.18	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	TCIRG1	Q13488	830 aa		15.18	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	ERFE	Q4G0M1	354 aa		15.18	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	SUSD4	Q5VX71	490 aa		15.18	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	MASTL	Q96GX5	879 aa		15.18	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		15.18	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	MYH3	P11055	1940 aa		15.17	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		15.17	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	CRY2	Q49AN0	593 aa		15.17	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		15.17	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	CNKSR1	Q969H4	720 aa		15.17	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	STK31	Q9BXU1	1019 aa		15.17	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	C21orf2	O43822	256 aa		15.16	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	NPR1	P16066	1061 aa		15.16	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	NLRP10	Q86W26	655 aa		15.16	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		15.16	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		15.16	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		15.15	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	LDHD	Q86WU2	507 aa		15.15	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		15.15	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
LTBP4-238	ENST00000622457	FAM177B	A6PVY3	158 aa		15.14	■□□□□ 0.01
LTBP4-238	ENST00000622457		E9PSI1	815 aa		15.14	■□□□□ 0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	VAMP4	O75379	141 aa		15.14	■□□□□ 0.01
LTBP4-238	ENST00000622457	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01

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