RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617744.4

NUDT13-208, Transcript of nudix hydrolase 13, human

TSL 5 BASIC

Gene NUDT13, Length 928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUDT13-208	ENST00000617744	FAM89A	Q96GI7	184 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	NLRP3	Q96P20	1036 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	CHD4	Q14839	1912 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	SLC51A	Q86UW1	340 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	NUP98	P52948	1817 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	ALDH1B1	P30837	517 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	PRELP	P51888	382 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	IL16	Q14005	1332 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	NFKBIE	O00221	500 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	RGL2	O15211	777 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	VAMP4	O75379	141 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	LMNB1	P20700	586 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	RRAGC	Q9HB90	399 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	CCER2	I3L3R5	266 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	CCDC93	Q567U6	631 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	UTRN	P46939	3433 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	CACNA1S	Q13698	1873 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	KSR2	Q6VAB6	950 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
NUDT13-208	ENST00000617744	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	SLX4	Q8IY92	1834 aa		10.21	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744		F6X3S4	739 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	FLII	Q13045	1269 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	ABCC4	O15439	1325 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	C1QTNF8	P60827	252 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	CRY2	Q49AN0	593 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	SOGA3	Q5TF21	947 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	ADCY9	O60503	1353 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	IGKV5-2	P06315	115 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	10.18	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744		E9PSI1	815 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	RIMBP2	O15034	1052 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	10.17	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	SLFN5	Q08AF3	891 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	GRAP	Q13588	217 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	ZNF521	Q96K83	1311 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	KIF3C	O14782	793 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	AOC3	Q16853	763 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	MPND	Q8N594	471 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUDT13-208	ENST00000617744	JDP2	Q8WYK2	163 aa		10.16	□□□□□ -0.78

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