RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598968.5

TIMM44-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, human

TSL 3

Gene TIMM44, Length 797 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM44-208	ENST00000598968	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF428	Q96B54	188 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	NPR1	P16066	1061 aa		29	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		29	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	SLFN5	Q08AF3	891 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	G2E3	Q7L622	706 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	MYD88	Q99836	296 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	KSR2	Q6VAB6	950 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	NLRP3	Q96P20	1036 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	CACNA1S	Q13698	1873 aa		28.95	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		28.95	■■■□□ 2.23
TIMM44-208	ENST00000598968	C21orf2	O43822	256 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	FLII	Q13045	1269 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	ALDH1B1	P30837	517 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	CRY2	Q49AN0	593 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	SYNE4	Q8N205	404 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	CACNA1F	O60840	1977 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	SLX4	Q8IY92	1834 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	FAM89A	Q96GI7	184 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	ADCY9	O60503	1353 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	28.89	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
TIMM44-208	ENST00000598968	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	RASSF7	Q02833	373 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	SOGA3	Q5TF21	947 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	RNF181	Q9P0P0	153 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	LAMB2	P55268	1798 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	IGKV5-2	P06315	115 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	CCDC93	Q567U6	631 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TIMM44-208	ENST00000598968	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	NFKBIE	O00221	500 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	SBF1	O95248	1867 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968		F6X3S4	739 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	LMNB1	P20700	586 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	OLFM4	Q6UX06	510 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	ABCC4	O15439	1325 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	LINS1	Q8NG48	757 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	PRELP	P51888	382 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	UTRN	P46939	3433 aa		28.76	■■■□□ 2.2
TIMM44-208	ENST00000598968	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	PDE8A	O60658	829 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	BBOX1	O75936	387 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	GCKR	Q14397	625 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	GRAP	Q13588	217 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		28.74	■■■□□ 2.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms