RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 SMC1BQ8NDV3 1235 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP17.37■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 C3orf67Q6ZVT6 689 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 XAGE3Q8WTP9 111 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 CFAP44Q96MT7 982 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 HOXB7P09629 217 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 ZNF853P0CG23 659 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 SLC10A5Q5PT55 438 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 APAF1O14727 1248 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 DDNO94850 711 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 CRAMP1Q96RY5 1269 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 CHPF2Q9P2E5 772 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 HTRA3P83110 453 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 NLRP10Q86W26 655 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 SYNE4Q8N205 404 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 PSMD1Q99460 953 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 MBIPQ9NS73 344 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 RNF123Q5XPI4 1314 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 TCIRG1Q13488 830 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 MIER1Q8N108 512 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 ZNF541Q9H0D2 1346 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 IARSP41252 1262 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 CCDC184Q52MB2 194 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 DUSP27Q5VZP5 1158 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 SLC51AQ86UW1 340 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 NLRP3Q96P20 1036 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 IFT57Q9NWB7 429 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 FZD9O00144 591 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 PLBD2Q8NHP8 589 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 GRIPAP1Q4V328 841 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa17.28■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 GNAI1P63096 354 aa17.28■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa17.28■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 KLRG1Q96E93 195 aa17.28■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 ISCA1Q9BUE6 129 aa17.28■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 ABCC4O15439 1325 aa17.27■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 COL4A5P29400 1685 aa17.27■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 IQCA1LA6NCM1 817 aa17.27■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 POTEIP0CG38 1075 aa17.27■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 POTEJP0CG39 1038 aa17.27■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 HYPKQ9NX55 129 aa17.27■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa17.27■□□□□ 0.36
CTIF-210ENST00000591412 SH3TC1Q8TE82 1336 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 CHADLQ6NUI6 762 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 JMYQ8N9B5 988 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 SCN4AP35499 1836 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 BBOX1O75936 387 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 GPC2Q8N158 579 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 C8orf58Q8NAV2 365 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 JDP2Q8WYK2 163 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 LDHDQ86WU2 507 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 SP8Q8IXZ3 490 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 ZNF428Q96B54 188 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 HACL1Q9UJ83 578 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 LAMB2P55268 1798 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 GRAPQ13588 217 aa17.22■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 CCDC27Q2M243 656 aa17.22■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 LARGE2Q8N3Y3 721 aa17.22■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 FAM89AQ96GI7 184 aa17.22■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 VPS33BQ9H267 617 aa17.22■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 EPHX2P34913 555 aa17.21■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 EIF6P56537 245 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
CTIF-210ENST00000591412 PASKQ96RG2 1323 aa17.21■□□□□ 0.34
CTIF-210ENST00000591412 PPIP5K2O43314 1243 aa17.2■□□□□ 0.34
CTIF-210ENST00000591412 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CTIF-210ENST00000591412 WWC1Q8IX03 1113 aa17.2■□□□□ 0.34
CTIF-210ENST00000591412 TSPYL6Q8N831 410 aa17.2■□□□□ 0.34
CTIF-210ENST00000591412 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
CTIF-210ENST00000591412 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa17.2■□□□□ 0.34
CTIF-210ENST00000591412 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
CTIF-210ENST00000591412 GOLGA2Q08379 1002 aa17.19■□□□□ 0.34
CTIF-210ENST00000591412 AOC3Q16853 763 aa17.19■□□□□ 0.34
CTIF-210ENST00000591412 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
CTIF-210ENST00000591412 RIC3Q7Z5B4 369 aa17.19■□□□□ 0.34
CTIF-210ENST00000591412 NIM1KQ8IY84 436 aa17.19■□□□□ 0.34
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