RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 PRO3102Q9H379 93 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 NCAPD2Q15021 1401 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 ERBB4Q15303 1308 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 FKTNO75072 461 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 ST5P78524 1137 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 USP48Q86UV5 1035 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 CNBD1Q8NA66 436 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 LRCH3Q96II8 777 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 PSMD1Q99460 953 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 FLT4P35916 1363 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 TBC1D9BQ66K14 1250 aa15.72■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1W2PPC1 479 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 DNAJC10Q8IXB1 793 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 TESK2Q96S53 571 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 NPR1P16066 1061 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 COL4A5P29400 1685 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 LARGE2Q8N3Y3 721 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 DEFB123Q8N688 67 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 ARMC5Q96C12 935 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 TRIM17Q9Y577 477 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 GPR153Q6NV75 609 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 DLK2Q6UY11 383 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 RASAL3Q86YV0 1011 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.67■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A087WZG4 1122 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 OTOP1Q7RTM1 612 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 NIM1KQ8IY84 436 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 TRPM4Q8TD43 1214 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 DPF3Q92784 378 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 SETDB2Q96T68 719 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-209ENST00000590049 SNX27Q96L92 541 aa15.64■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 TTC28Q96AY4 2481 aa15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 CACNA1AO00555 2505 aa15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 SNED1Q8TER0 1413 aa15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 ALDH1B1P30837 517 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 EYA1Q99502 592 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 PTPN22Q9Y2R2 807 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15.61■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 Q7L0L9 218 aa15.61■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 MTMR10Q9NXD2 777 aa15.61■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa15.6■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 TM4SF4P48230 202 aa15.6■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.6■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 EIF5P55010 431 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 CXCL9Q07325 125 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF333Q96JL9 665 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 MRC1P22897 1456 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-209ENST00000590049 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 ADM5C9JUS6 153 aa15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 MTHFSP49914 203 aa15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 NR2E3Q9Y5X4 410 aa15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 H7C1D1 291 aa15.57■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.57■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 SCN7AQ01118 1682 aa15.57■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 PPIP5K2O43314 1243 aa15.56■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNRF3Q9ULT6 936 aa15.56■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 SREBF2Q12772 1141 aa15.55■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.55■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 FYB1O15117 783 aa15.54■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 FKBP1BP68106 108 aa15.54■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 NBPF11Q86T75 865 aa15.54■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa15.54■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 MUC3AQ02505 3323 aa15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 ERO1AQ96HE7 468 aa15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 HTATIP2Q9BUP3 242 aa15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 TNIP1Q15025 636 aa15.52■□□□□ 0.08
CAPNS1-209ENST00000590049 AOC3Q16853 763 aa15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 525.1 ms