RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	NTSR2	O95665	410 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	ERFE	Q4G0M1	354 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	PTPRC	P08575	1304 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	LAMB2	P55268	1798 aa		31.71	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	ABCC12	Q96J65	1359 aa		31.7	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	KIF16B	Q96L93	1317 aa		31.7	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0G2JLW4	131 aa		31.69	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	PDE6B	P35913	854 aa		31.69	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	TGFB2	P61812	414 aa		31.69	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	BCAR3	O75815	825 aa		31.68	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	CHRNA5	P30532	468 aa		31.68	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		31.68	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	DPEP1	P16444	411 aa		31.67	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		31.67	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		31.67	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		31.67	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		31.66	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	MYH3	P11055	1940 aa		31.65	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229		H0YIN7	160 aa		31.65	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV5-2	P06315	115 aa		31.65	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	FAM89A	Q96GI7	184 aa		31.65	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		31.64	■■■□□ 2.66
GPS1-223	ENST00000584229	SYNE4	Q8N205	404 aa		31.63	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	LINS1	Q8NG48	757 aa		31.63	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	31.61	■■■□□ 2.65	1e-7	■■■■■ 27.3
GPS1-223	ENST00000584229	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		31.6	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		31.6	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	BEND3	Q5T5X7	828 aa		31.6	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		31.6	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	31.59	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		31.59	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		31.59	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	GCKR	Q14397	625 aa		31.58	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	GPR162	Q16538	588 aa		31.58	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	NLRP3	Q96P20	1036 aa		31.58	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	PIM2	Q9P1W9	311 aa		31.58	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		31.58	■■■□□ 2.65
GPS1-223	ENST00000584229	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		31.56	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	BCS1L	Q9Y276	419 aa		31.56	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		31.55	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	TAF1	P21675	1872 aa		31.55	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	ALDH1L1	O75891	902 aa		31.54	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	SRGN	P10124	158 aa		31.54	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	KCNA3	P22001	575 aa		31.54	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		31.54	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		31.54	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	MASTL	Q96GX5	879 aa		31.54	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	NPR1	P16066	1061 aa		31.53	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		31.53	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	SLX4	Q8IY92	1834 aa		31.53	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		31.52	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		31.52	■■■□□ 2.64
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM27	P14373	513 aa		31.51	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	STYK1	Q6J9G0	422 aa		31.51	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	TNN	Q9UQP3	1299 aa		31.51	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	SPEF2	Q9C093	1822 aa		31.51	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		31.5	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	31.5	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	TTLL6	Q8N841	843 aa		31.5	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	GRM8	O00222	908 aa		31.49	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	PDE8A	O60658	829 aa		31.49	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	31.49	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	CNKSR1	Q969H4	720 aa		31.49	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229		H7C1W4	665 aa		31.48	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	CRY2	Q49AN0	593 aa		31.48	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	ABCC4	O15439	1325 aa		31.48	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.63
GPS1-223	ENST00000584229	ALDH1B1	P30837	517 aa		31.44	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	CTSW	P56202	376 aa		31.43	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		31.43	■■■□□ 2.62
GPS1-223	ENST00000584229	CASP7	P55210	303 aa		31.42	■■■□□ 2.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms