RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583983.1

GPS1-222, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 5

Gene GPS1, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-222	ENST00000583983	CHD4	Q14839	1912 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	STYK1	Q6J9G0	422 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	G2E3	Q7L622	706 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	MASTL	Q96GX5	879 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		28.2	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	NPR1	P16066	1061 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	KSR2	Q6VAB6	950 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	CNKSR1	Q969H4	720 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	MYD88	Q99836	296 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	ADCY9	O60503	1353 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	FLII	Q13045	1269 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	CRY2	Q49AN0	593 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF428	Q96B54	188 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	SYNE4	Q8N205	404 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	CACNA1F	O60840	1977 aa		28.14	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		28.14	■■■□□ 2.1
GPS1-222	ENST00000583983	NLRP3	Q96P20	1036 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	FAM89A	Q96GI7	184 aa		28.12	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	SLX4	Q8IY92	1834 aa		28.11	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	C21orf2	O43822	256 aa		28.11	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	ALDH1B1	P30837	517 aa		28.1	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	IGKV5-2	P06315	115 aa		28.09	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		28.09	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		28.08	■■■□□ 2.09
GPS1-222	ENST00000583983	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		28.07	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	CACNA1S	Q13698	1873 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	RASSF7	Q02833	373 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	SOGA3	Q5TF21	947 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	NFKBIE	O00221	500 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	LAMB2	P55268	1798 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983		F6X3S4	739 aa		28.02	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
GPS1-222	ENST00000583983	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	CCDC93	Q567U6	631 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	OLFM4	Q6UX06	510 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	LINS1	Q8NG48	757 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	ABCC4	O15439	1325 aa		28	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	PRELP	P51888	382 aa		28	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	GCKR	Q14397	625 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	RNF181	Q9P0P0	153 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	SBF1	O95248	1867 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	LMNB1	P20700	586 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	BEND3	Q5T5X7	828 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983		H7C1W4	665 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	PDE8A	O60658	829 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	PTPRC	P08575	1304 aa		27.95	■■■□□ 2.07
GPS1-222	ENST00000583983	BBOX1	O75936	387 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	GRAP	Q13588	217 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06

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