RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PTPRM-215	ENST00000583289	DPYD	Q12882	1025 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PTPRM-215	ENST00000583289	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC30A3	Q99726	388 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PTPRM-215	ENST00000583289	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PTPRM-215	ENST00000583289	IGFBP4	P22692	258 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	RTN1	Q16799	776 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	EFCC1	Q9HA90	598 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	IER5	Q5VY09	327 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	NGLY1	Q96IV0	654 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	ADAM23	O75077	832 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	ADH7	P40394	386 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	BAG6	P46379	1132 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM11	Q96F44	468 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	PLVAP	Q9BX97	442 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289		M0R082	166 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	FOXO3	O43524	673 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	EPB42	P16452	691 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	CD163	Q86VB7	1156 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	BHMT	Q93088	406 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	ARX	Q96QS3	562 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	ALB	P02768	609 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	WEE1	P30291	646 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	CHRNA4	P43681	627 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	PNMA5	Q96PV4	448 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	7.15	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PTPRM-215	ENST00000583289	RFX1	P22670	979 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	LILRB5	O75023	590 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	LGR5	O75473	907 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	APBA3	O96018	575 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	CCIN	Q13939	588 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	GSX2	Q9BZM3	304 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	BCS1L	Q9Y276	419 aa		7.13	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	ARSD	P51689	593 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	PCSK7	Q16549	785 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	MYO19	Q96H55	970 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	NACC1	Q96RE7	527 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	FURIN	P09958	794 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	NID1	P14543	1247 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	INPP5B	P32019	993 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	GATA4	P43694	442 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	IDH3A	P50213	366 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	DGKZ	Q13574	1117 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	IGFLR1	Q9H665	355 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	KLK14	Q9P0G3	267 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	NFKB1	P19838	968 aa		7.1	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		7.1	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		7.1	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	MAP3K6	O95382	1288 aa		7.09	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
PTPRM-215	ENST00000583289	MICAL2	O94851	1124 aa		7.08	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		7.08	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	WIZ	O95785	1651 aa		7.07	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM229A	H3BQW9	127 aa		7.07	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	RAC1	P63000	192 aa		7.07	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	CDCA8	Q53HL2	280 aa		7.07	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		7.07	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	SMARCA4	P51532	1647 aa		7.06	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		7.06	□□□□□ -1.28

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