RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580799.2

GGA3-210, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5

Gene GGA3, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-210	ENST00000580799	CAPN15	O75808	1086 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	MYL6B	P14649	208 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	GPT	P24298	496 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	NTSR2	O95665	410 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	AIDA	Q96BJ3	306 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	COL4A5	P29400	1685 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	RASSF10	A6NK89	507 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	FOXN1	O15353	648 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	VEGFB	P49765	207 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	VPS33B	Q9H267	617 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-210	ENST00000580799	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	WBP1L	Q9NX94	342 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	SCNN1D	P51172	638 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	PDIA6	Q15084	440 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	LAMB2	P55268	1798 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	PPIP5K2	O43314	1243 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	BBOX1	O75936	387 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	EPS15	P42566	896 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	RIPK4	P57078	832 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	RALBP1	Q15311	655 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	AOC3	Q16853	763 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	SP8	Q8IXZ3	490 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	ABCC4	O15439	1325 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	ECE1	P42892	770 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	LBX1	P52954	281 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	CXCL9	Q07325	125 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	TMC4	Q7Z404	712 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	SLC51A	Q86UW1	340 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	MPND	Q8N594	471 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-210	ENST00000580799	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-210	ENST00000580799	ANXA1	P04083	346 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-210	ENST00000580799	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-210	ENST00000580799	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-210	ENST00000580799	TNIP1	Q15025	636 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-210	ENST00000580799	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-210	ENST00000580799	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-210	ENST00000580799	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-210	ENST00000580799	CHL1	O00533	1208 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-210	ENST00000580799	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26

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