RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF16BQ96L93 1317 aa42.13■■■■■ 4.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUTM1Q86Y26 1132 aa42.13■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa42.13■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV5-2P06315 115 aa42.11■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 PXDNLA1KZ92 1463 aa42.11■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERFEQ4G0M1 354 aa42.1■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINS1Q8NG48 757 aa42.1■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCAR3O75815 825 aa42.09■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDE6BP35913 854 aa42.09■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH3TC1Q8TE82 1336 aa42.08■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCC12Q96J65 1359 aa42.08■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEURL1BA8MQ27 555 aa42.07■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIC1Q4ADV7 1423 aa42.07■■■■■ 4.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa42.06■■■■■ 4.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 BEND3Q5T5X7 828 aa42.05■■■■■ 4.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC4A10Q6U841 1118 aa42.05■■■■■ 4.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0G2JLW4 131 aa42.04■■■■■ 4.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP45Q92619 1136 aa42.04■■■■■ 4.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 DPEP1P16444 411 aa42.03■■■■■ 4.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC10A5Q5PT55 438 aa42.02■■■■■ 4.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM89AQ96GI7 184 aa42.02■■■■■ 4.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRNA5P30532 468 aa42.01■■■■■ 4.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 DLEC1Q9Y238 1755 aa42.01■■■■■ 4.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 H0YIN7 160 aa42■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 GCKRQ14397 625 aa42■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2CD5Q86YS7 1000 aa42■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYNE4Q8N205 404 aa42■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNA3P22001 575 aa41.99■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa41.99■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALDH1L1O75891 902 aa41.97■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 RCAN3Q9UKA8 241 aa41.97■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAMB2P55268 1798 aa41.95■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRGNP10124 158 aa41.95■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 NLRP3Q96P20 1036 aa41.95■■■■■ 4.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRY2Q49AN0 593 aa41.94■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa41.94■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIM2Q9P1W9 311 aa41.94■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDHR2Q9BYE9 1310 aa41.92■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa41.92■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 H7C1W4 665 aa41.91■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM27P14373 513 aa41.91■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 MASTLQ96GX5 879 aa41.91■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPR1P16066 1061 aa41.9■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 STYK1Q6J9G0 422 aa41.9■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa41.9■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 C3orf67Q6ZVT6 689 aa41.89■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP41.89■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCC4O15439 1325 aa41.88■■■■■ 4.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCT4P50991 539 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 WWC3Q9ULE0 1092 aa41.88■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRM8O00222 908 aa41.86■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 CASP7P55210 303 aa41.85■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTLL6Q8N841 843 aa41.85■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNKSR1Q969H4 720 aa41.85■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDE8AO60658 829 aa41.84■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR162Q16538 588 aa41.83■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCS1LQ9Y276 419 aa41.83■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYH3P11055 1940 aa41.83■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCAF8L1A6NGE4 600 aa41.81■■■■■ 4.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLUAP1Q96AJ1 413 aa41.81■■■■■ 4.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa41.81■■■■■ 4.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACNA1SQ13698 1873 aa41.8■■■■■ 4.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALDH1B1P30837 517 aa41.8■■■■■ 4.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNNQ9UQP3 1299 aa41.8■■■■■ 4.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP41.79■■■■■ 4.281e-6■■□□□ 13.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 UTYO14607 1347 aa41.79■■■■■ 4.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLA2G12BQ9BX93 195 aa41.79■■■■■ 4.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRAMP1Q96RY5 1269 aa41.77■■■■■ 4.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 UTRNP46939 3433 aa41.76■■■■■ 4.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms