RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571386.1

SPNS2-204, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-204ENST00000571386 CFAP44Q96MT7 982 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 SRGNP10124 158 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 NECTIN2Q92692 538 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 MASTLQ96GX5 879 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 VEGFBP49765 207 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 HOXB7P09629 217 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 GPTP24298 496 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 MRS2Q9HD23 443 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 NPR1P16066 1061 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 GNAI1P63096 354 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 PDIA6Q15084 440 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 IFT57Q9NWB7 429 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 ANXA1P04083 346 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 KRT24Q2M2I5 525 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 PROSER3Q2NL68 480 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 CCDC93Q567U6 631 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 MBIPQ9NS73 344 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 LBX1P52954 281 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 CCDC184Q52MB2 194 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 PARP10Q53GL7 1025 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 COPS6Q7L5N1 327 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 WBP1LQ9NX94 342 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 HACL1Q9UJ83 578 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF853P0CG23 659 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 ALDH1B1P30837 517 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 EPHX2P34913 555 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-204ENST00000571386 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.52■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 RASSF10A6NK89 507 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 SLC34A2O95436 690 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 SUSD4Q5VX71 490 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 ABCC12Q96J65 1359 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 HYPKQ9NX55 129 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 OLFM4Q6UX06 510 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 LTBP1Q14766 1721 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 NTSR2O95665 410 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 CCDC27Q2M243 656 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 FAM161AQ3B820 660 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 CRY2Q49AN0 593 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 CNTROBQ8N137 903 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 ABHD8Q96I13 439 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 TCIRG1Q13488 830 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 NLRP3Q96P20 1036 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-204ENST00000571386 COL4A5P29400 1685 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS2-204ENST00000571386 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SPNS2-204ENST00000571386 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SPNS2-204ENST00000571386 SNED1Q8TER0 1413 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS2-204ENST00000571386 FZD9O00144 591 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-204ENST00000571386 NLRP10Q86W26 655 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-204ENST00000571386 WWC1Q8IX03 1113 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-204ENST00000571386 GPC2Q8N158 579 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-204ENST00000571386 GOLGA2Q08379 1002 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-204ENST00000571386 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-204ENST00000571386 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-204ENST00000571386 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-204ENST00000571386 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SPNS2-204ENST00000571386 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS2-204ENST00000571386 SYNE4Q8N205 404 aa21.42■■□□□ 1.02
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