RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	WDR90	Q96KV7	1748 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PPP4C-208	ENST00000564966	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
PPP4C-208	ENST00000564966	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PPP4C-208	ENST00000564966	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
PPP4C-208	ENST00000564966	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		33	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	SYNE4	Q8N205	404 aa		33	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	33	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		33	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	POTEC	B2RU33	542 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	NLRP3	Q96P20	1036 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	APAF1	O14727	1248 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	CFAP44	Q96MT7	982 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PPP4C-208	ENST00000564966	JDP2	Q8WYK2	163 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF428	Q96B54	188 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	MBIP	Q9NS73	344 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	HOXB7	P09629	217 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	TCIRG1	Q13488	830 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	NLRP10	Q86W26	655 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	PSMD1	Q99460	953 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	KLRG1	Q96E93	195 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	CHADL	Q6NUI6	762 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PPP4C-208	ENST00000564966	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	GNAI1	P63096	354 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	IFT57	Q9NWB7	429 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	HYPK	Q9NX55	129 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	POTEI	P0CG38	1075 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	POTEJ	P0CG39	1038 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	ABCC4	O15439	1325 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC51A	Q86UW1	340 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	HACL1	Q9UJ83	578 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	FZD9	O00144	591 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF853	P0CG23	659 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	SCN4A	P35499	1836 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	LDHD	Q86WU2	507 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	GPC2	Q8N158	579 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	SNED1	Q8TER0	1413 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	PPIP5K2	O43314	1243 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	GOLGA2	Q08379	1002 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	NIM1K	Q8IY84	436 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	EPHX2	P34913	555 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC184	Q52MB2	194 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	BBOX1	O75936	387 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM89A	Q96GI7	184 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	LAMB2	P55268	1798 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
PPP4C-208	ENST00000564966	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	AOC3	Q16853	763 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	GRAP	Q13588	217 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	SP8	Q8IXZ3	490 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	MPND	Q8N594	471 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	COL4A5	P29400	1685 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	JMY	Q8N9B5	988 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	MRS2	Q9HD23	443 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	ANP32C	O43423	234 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	MYD88	Q99836	296 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		32.7	■■■□□ 2.83

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