RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562996.1

AC068987.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC068987.1, Length 427 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC068987.1-201ENST00000562996 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
AC068987.1-201ENST00000562996 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
AC068987.1-201ENST00000562996 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
AC068987.1-201ENST00000562996 KCNA3P22001 575 aa25.28■■□□□ 1.64
AC068987.1-201ENST00000562996 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
AC068987.1-201ENST00000562996 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.27■■□□□ 1.64
AC068987.1-201ENST00000562996 PDE6BP35913 854 aa25.26■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.26■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.25■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.25■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 F6X3S4 739 aa25.24■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 GPR162Q16538 588 aa25.24■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 SYNE4Q8N205 404 aa25.24■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.24■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 LAMB2P55268 1798 aa25.23■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.23■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 H0YIN7 160 aa25.23■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 IGKV5-2P06315 115 aa25.23■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 UTRNP46939 3433 aa25.23■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 CACNA1SQ13698 1873 aa25.23■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.22■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.22■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 PIM2Q9P1W9 311 aa25.21■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.21■■□□□ 1.63
AC068987.1-201ENST00000562996 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.2■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.2■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.2■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 FAM89AQ96GI7 184 aa25.2■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 BCS1LQ9Y276 419 aa25.2■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.19■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 SRGNP10124 158 aa25.19■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.19■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 PTPRCP08575 1304 aa25.18■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 CRY2Q49AN0 593 aa25.17■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.17■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 LINS1Q8NG48 757 aa25.17■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.16■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 MASTLQ96GX5 879 aa25.16■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 SLX4Q8IY92 1834 aa25.15■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 NPR1P16066 1061 aa25.15■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 BEND3Q5T5X7 828 aa25.15■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 STYK1Q6J9G0 422 aa25.15■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 TTLL6Q8N841 843 aa25.15■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 GCKRQ14397 625 aa25.14■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 NLRP3Q96P20 1036 aa25.14■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
AC068987.1-201ENST00000562996 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
AC068987.1-201ENST00000562996 BCAR3O75815 825 aa25.13■■□□□ 1.61
AC068987.1-201ENST00000562996 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
AC068987.1-201ENST00000562996 KIF16BQ96L93 1317 aa25.12■■□□□ 1.61
AC068987.1-201ENST00000562996 GRIN3BO60391 1043 aa25.11■■□□□ 1.61
AC068987.1-201ENST00000562996 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
AC068987.1-201ENST00000562996 CNKSR1Q969H4 720 aa25.11■■□□□ 1.61
AC068987.1-201ENST00000562996 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.1■■□□□ 1.61
AC068987.1-201ENST00000562996 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
AC068987.1-201ENST00000562996 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.1■■□□□ 1.61
AC068987.1-201ENST00000562996 TAF1P21675 1872 aa25.09■■□□□ 1.61
AC068987.1-201ENST00000562996 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
AC068987.1-201ENST00000562996 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.09■■□□□ 1.61
AC068987.1-201ENST00000562996 MYH3P11055 1940 aa25.09■■□□□ 1.61
AC068987.1-201ENST00000562996 H7C1W4 665 aa25.08■■□□□ 1.61
AC068987.1-201ENST00000562996 COL4A1P02462 1669 aa25.07■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 ALDH1L1O75891 902 aa25.07■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 CASP7P55210 303 aa25.07■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 C21orf2O43822 256 aa25.06■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 ALDH1B1P30837 517 aa25.06■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 ABCC4O15439 1325 aa25.06■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 CHD4Q14839 1912 aa25.06■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 PDE8AO60658 829 aa25.05■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.05■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.05■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 GRM8O00222 908 aa25.04■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 SLC51AQ86UW1 340 aa25.04■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.04■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 TNNQ9UQP3 1299 aa25.04■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 TRIM27P14373 513 aa25.03■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 CTSWP56202 376 aa25.03■■□□□ 1.6
AC068987.1-201ENST00000562996 OLFM4Q6UX06 510 aa25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms