RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562903.5

KIFC3-211, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KIFC3, Length 3,221 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-211ENST00000562903 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
KIFC3-211ENST00000562903 TRERF1Q96PN7 1200 aa16.03■□□□□ 0.16
KIFC3-211ENST00000562903 BOLA2Q9H3K6 86 aa16.03■□□□□ 0.16
KIFC3-211ENST00000562903 DACT1Q9NYF0 836 aa16.03■□□□□ 0.16
KIFC3-211ENST00000562903 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa16.03■□□□□ 0.16
KIFC3-211ENST00000562903 PTPRUQ92729 1446 aa16.03■□□□□ 0.16
KIFC3-211ENST00000562903 SBNO1A3KN83 1393 aa16.03■□□□□ 0.16
KIFC3-211ENST00000562903 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
KIFC3-211ENST00000562903 KRT85P78386 507 aa16.03■□□□□ 0.16
KIFC3-211ENST00000562903 AACSQ86V21 672 aa16.03■□□□□ 0.16
KIFC3-211ENST00000562903 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
KIFC3-211ENST00000562903 IGSF1Q8N6C5 1336 aa16.02■□□□□ 0.16
KIFC3-211ENST00000562903 RAD50Q92878 1312 aa16.02■□□□□ 0.16
KIFC3-211ENST00000562903 PTH1RQ03431 593 aa16.02■□□□□ 0.16
KIFC3-211ENST00000562903 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
KIFC3-211ENST00000562903 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa16.02■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 OVOS2Q6IE36 1432 aa16.02■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 ZNF75DP51815 510 aa16.02■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 ADCK5Q3MIX3 580 aa16.02■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 TTC6Q86TZ1 520 aa16.02■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 PDRG1Q9NUG6 133 aa16.02■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 SALL3Q9BXA9 1300 aa16.01■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 CNTROBQ8N137 903 aa16.01■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 BICD2Q8TD16 824 aa16.01■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 CHGBP05060 677 aa16.01■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 TERF2Q15554 542 aa16.01■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 TTC14Q96N46 770 aa16.01■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 DNAJC25Q9H1X3 360 aa16.01■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.01■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 MAP3K5Q99683 1374 aa16.01■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 ZNF165P49910 485 aa16■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 FAM227BQ96M60 508 aa16■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 SGSM2O43147 1006 aa16■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 C1orf141Q5JVX7 400 aa16■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 PLCD3Q8N3E9 789 aa16■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 ST7Q9NRC1 585 aa16■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 PHF8Q9UPP1 1060 aa16■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 SYCP1Q15431 976 aa15.99■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 PTPN14Q15678 1187 aa15.99■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 ELF2Q15723 593 aa15.99■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.99■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 KIF1BPQ96EK5 621 aa15.99■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 TIGD1Q96MW7 591 aa15.99■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 ORAI2Q96SN7 254 aa15.99■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.99■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.99■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 ARID5BQ14865 1188 aa15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 SPATA32Q96LK8 384 aa15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 STAP2Q9UGK3 403 aa15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 ARHGEF10O15013 1369 aa15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 CCDC144BQ3MJ40 725 aa15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 CDC37L1Q7L3B6 337 aa15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 USP27XA6NNY8 438 aa15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 FBXW7Q969H0 707 aa15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 HYPKQ9NX55 129 aa15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 PEAK1Q9H792 1746 aa15.98■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 LRRC2Q9BYS8 371 aa15.97■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 TTC21AQ8NDW8 1320 aa15.97■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.97■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 PI4K2BQ8TCG2 481 aa15.97■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa15.96■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 SSH3Q8TE77 659 aa15.96■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa15.96■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 FSD1Q9BTV5 496 aa15.96■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
KIFC3-211ENST00000562903 ME3Q16798 604 aa15.96■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.96■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa15.95■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 SKILP12757 684 aa15.95■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 TAF6LQ9Y6J9 622 aa15.95■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.95■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 BEND3Q5T5X7 828 aa15.95■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.95■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 ITSN1Q15811 1721 aa15.95■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 SLFNL1Q499Z3 407 aa15.94■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 GTF3C6Q969F1 213 aa15.94■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
KIFC3-211ENST00000562903 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms