RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557694.1

LGMN-218, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 2

Gene LGMN, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-218ENST00000557694 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LGMN-218ENST00000557694 ZNF853P0CG23 659 aa20.21■□□□□ 0.83
LGMN-218ENST00000557694 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
LGMN-218ENST00000557694 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 APLP1P51693 650 aa20.2■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 CCDC93Q567U6 631 aa20.2■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.2■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.19■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 NLRP10Q86W26 655 aa20.19■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 LTBP1Q14766 1721 aa20.19■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.17■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 FSTL1Q12841 308 aa20.17■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.17■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.17■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.16■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 CFAP44Q96MT7 982 aa20.16■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 NYXQ9GZU5 481 aa20.16■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.15■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 TCIRG1Q13488 830 aa20.15■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 TSPYL6Q8N831 410 aa20.15■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LGMN-218ENST00000557694 ABCC4O15439 1325 aa20.14■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.14■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.14■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 FZD9O00144 591 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 ALDH1B1P30837 517 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 PCNTO95613 3336 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.12■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 KLRG1Q96E93 195 aa20.12■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.12■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 PARP10Q53GL7 1025 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 SOGA3Q5TF21 947 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.1■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.1■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 FAM89AQ96GI7 184 aa20.1■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 PSMD1Q99460 953 aa20.1■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.09■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.08■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 NLRP3Q96P20 1036 aa20.08■□□□□ 0.81
LGMN-218ENST00000557694 SCN4AP35499 1836 aa20.08■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 AOC3Q16853 763 aa20.07■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 JMYQ8N9B5 988 aa20.07■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 IFT57Q9NWB7 429 aa20.07■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.07■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 SCNN1DP51172 638 aa20.06■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 CHADLQ6NUI6 762 aa20.06■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 PASKQ96RG2 1323 aa20.05■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 SHTN1A0MZ66 631 aa20.05■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 HOXB7P09629 217 aa20.05■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 EPS15P42566 896 aa20.05■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 G2E3Q7L622 706 aa20.05■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.04■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.04■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.04■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 EPHX2P34913 555 aa20.03■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.03■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 YDJCA8MPS7 323 aa20.02■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 GNAI1P63096 354 aa20.02■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.02■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 WWC1Q8IX03 1113 aa20.02■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.02■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 HYPKQ9NX55 129 aa20.02■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 HACL1Q9UJ83 578 aa20.02■□□□□ 0.8
LGMN-218ENST00000557694 PPIP5K2O43314 1243 aa20.01■□□□□ 0.79
LGMN-218ENST00000557694 CXCL9Q07325 125 aa20.01■□□□□ 0.79
LGMN-218ENST00000557694 GRAPQ13588 217 aa20.01■□□□□ 0.79
LGMN-218ENST00000557694 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms