RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555009.5

RPS6KL1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS6KL1, Length 2,457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-209ENST00000555009 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.15■■□□□ 1.14
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RPS6KL1-209ENST00000555009 ATF3P18847 181 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS6KL1-209ENST00000555009 HSPA2P54652 639 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS6KL1-209ENST00000555009 KCNB2Q92953 911 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS6KL1-209ENST00000555009 MTX1Q13505 466 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.14■■□□□ 1.13
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RPS6KL1-209ENST00000555009 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 ADCY9O60503 1353 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 PLCB2Q00722 1185 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 ST3GAL1Q11201 340 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 ME3Q16798 604 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.12■■□□□ 1.13
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RPS6KL1-209ENST00000555009 NECTIN1Q15223 517 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 GPATCH3Q96I76 525 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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RPS6KL1-209ENST00000555009 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 AP5Z1O43299 807 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 NECAB1Q8N987 351 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 EVI5LQ96CN4 794 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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RPS6KL1-209ENST00000555009 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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RPS6KL1-209ENST00000555009 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.08■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCDC192P0DO97 292 aa22.08■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 PROSER3Q2NL68 480 aa22.08■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 AACSQ86V21 672 aa22.08■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.08■■□□□ 1.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 ALDH1L1O75891 902 aa22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 KCNJ4P48050 445 aa22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 CHRNA2Q15822 529 aa22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 TSC1Q92574 1164 aa22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 MAP4K1Q92918 833 aa22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM227BQ96M60 508 aa22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 TTC6Q86TZ1 520 aa22.06■■□□□ 1.12
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RPS6KL1-209ENST00000555009 KRT85P78386 507 aa22.05■■□□□ 1.12
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RPS6KL1-209ENST00000555009 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.05■■□□□ 1.12
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RPS6KL1-209ENST00000555009 SLC27A2O14975 620 aa22.04■■□□□ 1.12
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RPS6KL1-209ENST00000555009 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.04■■□□□ 1.12
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RPS6KL1-209ENST00000555009 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.03■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.03■■□□□ 1.12
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RPS6KL1-209ENST00000555009 ELP1O95163 1332 aa22.03■■□□□ 1.12
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RPS6KL1-209ENST00000555009 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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RPS6KL1-209ENST00000555009 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.02■■□□□ 1.12
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RPS6KL1-209ENST00000555009 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIF3AQ9Y496 699 aa22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 SASH1O94885 1247 aa22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 LIG1P18858 919 aa22.02■■□□□ 1.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.01■■□□□ 1.11
RPS6KL1-209ENST00000555009 CAMK4Q16566 473 aa22.01■■□□□ 1.11
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