RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 DKK1O94907 266 aa9.7□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.7□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.7□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.7□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.69□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.69□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.69□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 RASA1P20936 1047 aa9.68□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 GRIK4Q16099 956 aa9.68□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 HIF1AQ16665 826 aa9.68□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.68□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.68□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 NGLY1Q96IV0 654 aa9.68□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 LILRB5O75023 590 aa9.67□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.67□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.67□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 IGFLR1Q9H665 355 aa9.67□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 ARID3CA6NKF2 412 aa9.66□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 SEC13P55735 322 aa9.66□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 ARID3AQ99856 593 aa9.65□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.65□□□□□ -0.86
USP15-218ENST00000552346 GLMNQ92990 594 aa9.64□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.64□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 EFCC1Q9HA90 598 aa9.64□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 C9orf172C9J069 976 aa9.63□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 DYRK3O43781 588 aa9.63□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 NUDT8Q8WV74 236 aa9.63□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 HINFPQ9BQA5 517 aa9.63□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 A0A0A0MRY4 1105 aa9.62□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 RTN1Q16799 776 aa9.62□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 IER5Q5VY09 327 aa9.62□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 PNMA5Q96PV4 448 aa9.62□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 GSX2Q9BZM3 304 aa9.62□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 ELNP15502 786 aa9.61□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 RAC1P63000 192 aa9.61□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.6□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.6□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 LGR5O75473 907 aa9.6□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 SELPP16109 830 aa9.6□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 CCINQ13939 588 aa9.6□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 ADGRE1Q14246 886 aa9.6□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.6□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.6□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 NFKB1P19838 968 aa9.59□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 MBTPS1Q14703 1052 aa9.59□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP15-218ENST00000552346 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 DPYDQ12882 1025 aa9.58□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 NAGPAQ9UK23 515 aa9.58□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 BCS1LQ9Y276 419 aa9.58□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 EPB42P16452 691 aa9.57□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 IGFBP4P22692 258 aa9.57□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 PTK7Q13308 1070 aa9.57□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.57□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.57□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.56□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa9.56□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.56□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 FAM35AQ86V20 835 aa9.55□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.55□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.55□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 KLK14Q9P0G3 267 aa9.55□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 USP17L15C9J2P7 530 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 USP17L10C9JJH3 530 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 USP17L12C9JPN9 530 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 USP17L11C9JVI0 530 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 USP17L21D6R901 530 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 USP17L18D6R9N7 530 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 USP17L22D6RA61 530 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 USP17L19D6RCP7 530 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 USP17L20D6RJB6 530 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms