RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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PTPRB-211ENST00000552253 TERF1P54274 439 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-211ENST00000552253 ME3Q16798 604 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-211ENST00000552253 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.11□□□□□ -1.27
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PTPRB-211ENST00000552253 KLHL34Q8N239 644 aa7.09□□□□□ -1.28
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PTPRB-211ENST00000552253 FAM184AQ8NB25 1140 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.08□□□□□ -1.28
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PTPRB-211ENST00000552253 MEGF6O75095 1541 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.07□□□□□ -1.28
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