RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 GRM1Q13255 1194 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 LTBP1Q14766 1721 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 GPC2Q8N158 579 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 WBP1LQ9NX94 342 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 SNED1Q8TER0 1413 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 EPS15P42566 896 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 SUSD4Q5VX71 490 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-227ENST00000551441 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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CS-227ENST00000551441 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CS-227ENST00000551441 CRY2Q49AN0 593 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-227ENST00000551441 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-227ENST00000551441 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-227ENST00000551441 PSMD1Q99460 953 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-227ENST00000551441 NYXQ9GZU5 481 aa21.39■■□□□ 1.01
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CS-227ENST00000551441 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
CS-227ENST00000551441 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.38■■□□□ 1.01
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CS-227ENST00000551441 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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CS-227ENST00000551441 SCNN1DP51172 638 aa21.36■■□□□ 1.01
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CS-227ENST00000551441 NTSR2O95665 410 aa21.33■■□□□ 1.01
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CS-227ENST00000551441 ZNF428Q96B54 188 aa21.33■■□□□ 1.01
CS-227ENST00000551441 CAPNS2Q96L46 248 aa21.33■■□□□ 1.01
CS-227ENST00000551441 TSKSQ9UJT2 592 aa21.33■■□□□ 1.01
CS-227ENST00000551441 ANXA1P04083 346 aa21.32■■□□□ 1
CS-227ENST00000551441 NEFMP07197 916 aa21.32■■□□□ 1
CS-227ENST00000551441 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.32■■□□□ 1
CS-227ENST00000551441 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.32■■□□□ 1
CS-227ENST00000551441 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CS-227ENST00000551441 ABHD8Q96I13 439 aa21.32■■□□□ 1
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CS-227ENST00000551441 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.3■■□□□ 1
CS-227ENST00000551441 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.3■■□□□ 1
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CS-227ENST00000551441 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.29■■□□□ 1
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CS-227ENST00000551441 NLRP3Q96P20 1036 aa21.28■■□□□ 1
CS-227ENST00000551441 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CS-227ENST00000551441 ABCC4O15439 1325 aa21.28■■□□□ 1
CS-227ENST00000551441 CXCL9Q07325 125 aa21.27■■□□□ 1
CS-227ENST00000551441 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 FAM161AQ3B820 660 aa21.26■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.26■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.26■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.26■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.25■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 TAF1P21675 1872 aa21.25■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 ECE1P42892 770 aa21.25■□□□□ 0.99
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CS-227ENST00000551441 PDIA6Q15084 440 aa21.25■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.25■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.25■□□□□ 0.99
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CS-227ENST00000551441 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.25■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 LAMB2P55268 1798 aa21.25■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 SHTN1A0MZ66 631 aa21.24■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 RAD17O75943 681 aa21.24■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.24■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.24■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.23■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 PARP10Q53GL7 1025 aa21.23■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.23■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.22■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 DLK2Q6UY11 383 aa21.22■□□□□ 0.99
CS-227ENST00000551441 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.22■□□□□ 0.99
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