RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546935.5

CSRNP2-202, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene CSRNP2, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-202ENST00000546935 A0A087WZG4 1122 aa27.44■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 ISCA1Q9BUE6 129 aa27.44■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 TCIRG1Q13488 830 aa27.43■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 GCKRQ14397 625 aa27.43■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.43■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 C4AP0C0L4 1744 aa27.43■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 GNAI2P04899 355 aa27.42■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa27.42■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 KLHL34Q8N239 644 aa27.41■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.41■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 GRM8O00222 908 aa27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 CAMTA2O94983 1202 aa27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 IGHDP01880 384 aa27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 RFC4P35249 363 aa27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 SMIM5Q71RC9 77 aa27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 CCDC191Q8NCU4 936 aa27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 HLFQ16534 295 aa27.39■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.39■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 HDAC5Q9UQL6 1122 aa27.39■■□□□ 1.98
CSRNP2-202ENST00000546935 CEP85Q6P2H3 762 aa27.38■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 NLGN2Q8NFZ4 835 aa27.38■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa27.37■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 YY1P25490 414 aa27.37■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.37■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 GYS1P13807 737 aa27.36■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.36■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 CHD4Q14839 1912 aa27.35■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 MMP10P09238 476 aa27.35■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 CASP7P55210 303 aa27.35■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.35■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 NARFQ9UHQ1 456 aa27.35■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 H7C1W4 665 aa27.34■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 GPR162Q16538 588 aa27.34■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.34■■□□□ 1.97
CSRNP2-202ENST00000546935 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.32■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 GRIN3BO60391 1043 aa27.31■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 ATP8B2P98198 1209 aa27.31■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 MTX1Q13505 466 aa27.31■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 NLRP10Q86W26 655 aa27.31■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 KAZALD1Q96I82 304 aa27.31■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.31■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 SMC5Q8IY18 1101 aa27.3■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 SUCLG2Q96I99 432 aa27.3■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.29■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.29■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.27■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 ZPR1O75312 459 aa27.27■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 HMMRO75330 724 aa27.27■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 PARP10Q53GL7 1025 aa27.27■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa27.27■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 SSH3Q8TE77 659 aa27.27■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.27■■□□□ 1.96
CSRNP2-202ENST00000546935 POLA2Q14181 598 aa27.26■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 GCC1Q96CN9 775 aa27.26■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 LAMB2P55268 1798 aa27.25■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 GPTP24298 496 aa27.25■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 TGFB2P61812 414 aa27.25■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.25■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 DCTPP1Q9H773 170 aa27.25■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.24■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.24■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.23■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.22■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 EPHA10Q5JZY3 1008 aa27.22■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 FOXO4P98177 505 aa27.21■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 MYH3P11055 1940 aa27.21■■□□□ 1.95
CSRNP2-202ENST00000546935 TM4SF1P30408 202 aa27.2■■□□□ 1.94
CSRNP2-202ENST00000546935 SUSD4Q5VX71 490 aa27.2■■□□□ 1.94
CSRNP2-202ENST00000546935 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
CSRNP2-202ENST00000546935 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
CSRNP2-202ENST00000546935 SRGAP3O43295 1099 aa27.19■■□□□ 1.94
CSRNP2-202ENST00000546935 NTSR2O95665 410 aa27.19■■□□□ 1.94
CSRNP2-202ENST00000546935 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.19■■□□□ 1.94
CSRNP2-202ENST00000546935 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CSRNP2-202ENST00000546935 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CSRNP2-202ENST00000546935 FAM89AQ96GI7 184 aa27.18■■□□□ 1.94
CSRNP2-202ENST00000546935 DDR1Q08345 913 aa27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms