RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNHG1-222	ENST00000545308	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L3	A6NCW0	530 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L4	A6NCW7	530 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNHG1-222	ENST00000545308		M0R082	166 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNHG1-222	ENST00000545308	SPEM2	Q0P670	501 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNHG1-222	ENST00000545308	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SNHG1-222	ENST00000545308	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNHG1-222	ENST00000545308	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SNHG1-222	ENST00000545308		M0R2N6	131 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNQ4	P56696	695 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	NEUROD1	Q13562	356 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	BRD7	Q9NPI1	651 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	SFI1	A8K8P3	1242 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	APBA3	O96018	575 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	ALB	P02768	609 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	ADH7	P40394	386 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	OGFOD1	Q8N543	542 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	STK32A	Q8WU08	396 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	CEP63	Q96MT8	703 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	TYRO3	Q06418	890 aa		7	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		7	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		7	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		7	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF428	Q96B54	188 aa		7	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	SUSD3	Q96L08	255 aa		7	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		7	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM229A	H3BQW9	127 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	NID1	P14543	1247 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	SIX5	Q8N196	739 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	C21orf2	O43822	256 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	DKK1	O94907	266 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	NACC1	Q96RE7	527 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	6.97	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	SLAIN2	Q9P270	581 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
SNHG1-222	ENST00000545308	GRIK4	Q16099	956 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	BHMT	Q93088	406 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM196B	A6NMK8	535 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L15	C9J2P7	530 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L10	C9JJH3	530 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L12	C9JPN9	530 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L11	C9JVI0	530 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L21	D6R901	530 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L18	D6R9N7	530 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L22	D6RA61	530 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L19	D6RCP7	530 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L20	D6RJB6	530 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	LILRB5	O75023	590 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L24	Q0WX57	530 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	EFCC1	Q9HA90	598 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	DYRK3	O43781	588 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	PTK7	Q13308	1070 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	HIF1A	Q16665	826 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC27	Q2M243	656 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	C9orf172	C9J069	976 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SNHG1-222	ENST00000545308	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3

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