RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 PSMD1Q99460 953 aa25.42■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAP2K2P36507 400 aa25.41■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.4■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 CA12O43570 354 aa25.4■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 NFE2L2Q16236 605 aa25.39■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.39■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 OLFM4Q6UX06 510 aa25.39■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 GRM1Q13255 1194 aa25.38■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.38■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.37■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 BCORQ6W2J9 1755 aa25.37■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.37■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.37■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP16Q9Y5T5 823 aa25.37■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.37■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.37■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 CST9Q5W186 159 aa25.35■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.35■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 CFAP44Q96MT7 982 aa25.34■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 EPS15P42566 896 aa25.33■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 SCNN1DP51172 638 aa25.32■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.32■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.32■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.31■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 RIPK4P57078 832 aa25.31■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 CRY2Q49AN0 593 aa25.31■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.31■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.3■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 TSKSQ9UJT2 592 aa25.3■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 SNED1Q8TER0 1413 aa25.29■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM177BA6PVY3 158 aa25.29■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRAF5O00463 557 aa25.29■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.29■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 NYXQ9GZU5 481 aa25.29■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.28■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 AOC2O75106 756 aa25.28■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 NEUROD2Q15784 382 aa25.28■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC184Q52MB2 194 aa25.28■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 RUNDC1Q96C34 613 aa25.27■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.27■■□□□ 1.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 DGKZQ13574 1117 aa25.25■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 NIM1KQ8IY84 436 aa25.25■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 LTBP1Q14766 1721 aa25.24■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 VPS33BQ9H267 617 aa25.24■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.24■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.23■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBPF26B4DH59 902 aa25.23■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 HLFQ16534 295 aa25.23■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBPF15Q8N660 670 aa25.23■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL4A5P29400 1685 aa25.21■■□□□ 1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.2■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.19■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.19■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.19■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANP32CO43423 234 aa25.19■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.19■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 NOGQ13253 232 aa25.19■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.19■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.19■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.19■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPIP5K2O43314 1243 aa25.18■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.18■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.18■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.18■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABCC12Q96J65 1359 aa25.18■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.16■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.16■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.16■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 APAF1O14727 1248 aa25.15■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.15■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 CXCL9Q07325 125 aa25.14■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 AOC3Q16853 763 aa25.14■■□□□ 1.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.14■■□□□ 1.62
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