RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536172.5

LMO3-213, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 3

Gene LMO3, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-213ENST00000536172 NFE2L2Q16236 605 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-213ENST00000536172 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-213ENST00000536172 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 CAPN15O75808 1086 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 OLFM4Q6UX06 510 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 NGEFQ8N5V2 710 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 AIDAQ96BJ3 306 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 ABCC12Q96J65 1359 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 PARP10Q53GL7 1025 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 CNTROBQ8N137 903 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 VPS33BQ9H267 617 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 MYL6BP14649 208 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 RASSF10A6NK89 507 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 VEGFBP49765 207 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 NLRP3Q96P20 1036 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 FOXN1O15353 648 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 GPTP24298 496 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 SUSD4Q5VX71 490 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 NTSR2O95665 410 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 NIM1KQ8IY84 436 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 WBP1LQ9NX94 342 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-213ENST00000536172 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 SCNN1DP51172 638 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 COL4A5P29400 1685 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 LTBP1Q14766 1721 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 LAMB2P55268 1798 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 PPIP5K2O43314 1243 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 BBOX1O75936 387 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 ECE1P42892 770 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 EPS15P42566 896 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 RIPK4P57078 832 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 PDIA6Q15084 440 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 RALBP1Q15311 655 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 THSD7BQ9C0I4 1608 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 TMC4Q7Z404 712 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 SP8Q8IXZ3 490 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 ABCC4O15439 1325 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 AOC3Q16853 763 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-213ENST00000536172 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LMO3-213ENST00000536172 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LMO3-213ENST00000536172 LBX1P52954 281 aa14.52□□□□□ -0.09
LMO3-213ENST00000536172 TNIP1Q15025 636 aa14.52□□□□□ -0.09
LMO3-213ENST00000536172 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LMO3-213ENST00000536172 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.52□□□□□ -0.09
LMO3-213ENST00000536172 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LMO3-213ENST00000536172 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO3-213ENST00000536172 CXCL9Q07325 125 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO3-213ENST00000536172 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO3-213ENST00000536172 TCIRG1Q13488 830 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO3-213ENST00000536172 COPS6Q7L5N1 327 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO3-213ENST00000536172 NLRP10Q86W26 655 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO3-213ENST00000536172 MPNDQ8N594 471 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms