RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529073.5

CCDC90B-211, Transcript of coiled-coil domain containing 90B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CCDC90B, Length 719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90B-211ENST00000529073 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 TGFB2P61812 414 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 RASSF7Q02833 373 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 TAF1P21675 1872 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 NLRP10Q86W26 655 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 SLFN5Q08AF3 891 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 NPHP1O15259 732 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 GOLGA2Q08379 1002 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 TCIRG1Q13488 830 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 MYD88Q99836 296 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 HYPKQ9NX55 129 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 CHD4Q14839 1912 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 SRGNP10124 158 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 YY1P25490 414 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 ST5P78524 1137 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 PIM2Q9P1W9 311 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC90B-211ENST00000529073 F6X3S4 739 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 FAM89AQ96GI7 184 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 H0YIN7 160 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 C21orf2O43822 256 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 IGKV5-2P06315 115 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 NFKBIEO00221 500 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 RGL2O15211 777 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 FLIIQ13045 1269 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 PDE6BP35913 854 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 COL4A5P29400 1685 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 SBF1O95248 1867 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 SNED1Q8TER0 1413 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 E9PSI1 815 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 TTLL6Q8N841 843 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 STK31Q9BXU1 1019 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 TNNQ9UQP3 1299 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 SPEF2Q9C093 1822 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 CRY2Q49AN0 593 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 PARP10Q53GL7 1025 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 STYK1Q6J9G0 422 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 MASTLQ96GX5 879 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 NYXQ9GZU5 481 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-211ENST00000529073 GRIN3BO60391 1043 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 KSR2Q6VAB6 950 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 ABCC4O15439 1325 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 NPR1P16066 1061 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 RNF181Q9P0P0 153 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC90B-211ENST00000529073 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms