RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 NECTIN2Q92692 538 aa24.65■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 TAF1P21675 1872 aa24.64■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 ALDH1B1P30837 517 aa24.64■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 PARP10Q53GL7 1025 aa24.64■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.64■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 HTRA3P83110 453 aa24.63■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 COPS6Q7L5N1 327 aa24.63■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 HOXB7P09629 217 aa24.62■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 ZNF853P0CG23 659 aa24.62■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.62■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 CFAP44Q96MT7 982 aa24.62■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.62■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.62■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.61■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.61■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.6■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.6■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 MBIPQ9NS73 344 aa24.6■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 APAF1O14727 1248 aa24.59■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 NLRP10Q86W26 655 aa24.59■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.59■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 PSMD1Q99460 953 aa24.59■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.59■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.58■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CTTN-211ENST00000527622 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.58■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 POTEIP0CG38 1075 aa24.57■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 POTEJP0CG39 1038 aa24.57■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 CCDC184Q52MB2 194 aa24.57■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 SYNE4Q8N205 404 aa24.57■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 LTBP1Q14766 1721 aa24.57■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 TCIRG1Q13488 830 aa24.56■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.56■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.56■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 FZD9O00144 591 aa24.55■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.55■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 COL4A1P02462 1669 aa24.55■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 KLRG1Q96E93 195 aa24.54■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 IFT57Q9NWB7 429 aa24.54■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 ABCC4O15439 1325 aa24.54■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 NLRP3Q96P20 1036 aa24.53■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.52■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.52■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.52■■□□□ 1.52
CTTN-211ENST00000527622 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 JMYQ8N9B5 988 aa24.51■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.5■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.49■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 GNAI1P63096 354 aa24.49■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.49■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 CHADLQ6NUI6 762 aa24.49■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.49■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.49■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 HYPKQ9NX55 129 aa24.48■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 ZNF428Q96B54 188 aa24.47■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 LDHDQ86WU2 507 aa24.46■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 GPC2Q8N158 579 aa24.46■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.46■■□□□ 1.51
CTTN-211ENST00000527622 PASKQ96RG2 1323 aa24.45■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.45■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 JDP2Q8WYK2 163 aa24.44■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 HACL1Q9UJ83 578 aa24.44■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 GRAPQ13588 217 aa24.43■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.43■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 BBOX1O75936 387 aa24.42■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 EPHX2P34913 555 aa24.42■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 SP8Q8IXZ3 490 aa24.42■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 TSPYL6Q8N831 410 aa24.42■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 FAM89AQ96GI7 184 aa24.42■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 CACNA1FO60840 1977 aa24.42■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 SCNN1DP51172 638 aa24.41■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 AOC3Q16853 763 aa24.41■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 CCDC27Q2M243 656 aa24.41■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 MYH3P11055 1940 aa24.4■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 PPIP5K2O43314 1243 aa24.4■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CTTN-211ENST00000527622 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms