RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526290.1

TSTA3-204, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-204ENST00000526290 CFAP44Q96MT7 982 aa21.85■■□□□ 1.09
TSTA3-204ENST00000526290 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TSTA3-204ENST00000526290 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
TSTA3-204ENST00000526290 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TSTA3-204ENST00000526290 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TSTA3-204ENST00000526290 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TSTA3-204ENST00000526290 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TSTA3-204ENST00000526290 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.83■■□□□ 1.09
TSTA3-204ENST00000526290 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.83■■□□□ 1.09
TSTA3-204ENST00000526290 SYNE4Q8N205 404 aa21.83■■□□□ 1.09
TSTA3-204ENST00000526290 NLRP3Q96P20 1036 aa21.83■■□□□ 1.09
TSTA3-204ENST00000526290 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.83■■□□□ 1.09
TSTA3-204ENST00000526290 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.82■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.82■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.81■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 HOXB7P09629 217 aa21.81■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 HTRA3P83110 453 aa21.81■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 TCIRG1Q13488 830 aa21.81■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.81■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.81■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.81■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.81■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 MBIPQ9NS73 344 aa21.81■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 WDR90Q96KV7 1748 aa21.8■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 NLRP10Q86W26 655 aa21.8■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 ZNF853P0CG23 659 aa21.78■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 GNAI1P63096 354 aa21.78■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.78■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 PSMD1Q99460 953 aa21.78■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.77■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.77■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 IFT57Q9NWB7 429 aa21.77■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 HYPKQ9NX55 129 aa21.77■■□□□ 1.08
TSTA3-204ENST00000526290 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.77■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 CCDC184Q52MB2 194 aa21.76■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 JDP2Q8WYK2 163 aa21.76■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 ZNF428Q96B54 188 aa21.76■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.76■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.75■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 FZD9O00144 591 aa21.74■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 CHADLQ6NUI6 762 aa21.74■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.74■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 SLC51AQ86UW1 340 aa21.73■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 KLRG1Q96E93 195 aa21.73■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.73■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 SNED1Q8TER0 1413 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 BBOX1O75936 387 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 POTEIP0CG38 1075 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 POTEJP0CG39 1038 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 ABCC4O15439 1325 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 HACL1Q9UJ83 578 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-204ENST00000526290 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 GPC2Q8N158 579 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 SP8Q8IXZ3 490 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 FAM89AQ96GI7 184 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 GOLGA2Q08379 1002 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 LDHDQ86WU2 507 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 SCN4AP35499 1836 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 PPIP5K2O43314 1243 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 EPHX2P34913 555 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 NIM1KQ8IY84 436 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 ANP32CO43423 234 aa21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 GRAPQ13588 217 aa21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 MPNDQ8N594 471 aa21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 MRS2Q9HD23 443 aa21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 AOC3Q16853 763 aa21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 JMYQ8N9B5 988 aa21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 VPS33BQ9H267 617 aa21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 LAMB2P55268 1798 aa21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-204ENST00000526290 COL4A5P29400 1685 aa21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms