RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CDK1-208	ENST00000519760	PRMT3	O60678	531 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CDK1-208	ENST00000519760	KCNQ4	P56696	695 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CDK1-208	ENST00000519760	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CDK1-208	ENST00000519760	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	SIN3B	O75182	1162 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	DGKZ	Q13574	1117 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	ELOA3	Q8NG57	546 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	BHMT	Q93088	406 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	TRIM11	Q96F44	468 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	USP20	Q9Y2K6	914 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	GNB5	O14775	395 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	FOXO3	O43524	673 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	OCLN	Q16625	522 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	TNFRSF25	Q93038	417 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	GSX2	Q9BZM3	304 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	IGFLR1	Q9H665	355 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	SLAIN2	Q9P270	581 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	ALAS2	P22557	587 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	INPP5B	P32019	993 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	IDH3A	P50213	366 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	FAM26D	Q5JW98	314 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	COX20	Q5RI15	118 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	OPLAH	O14841	1288 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	MICAL2	O94851	1124 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	ATG7	O95352	703 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	ALB	P02768	609 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	ADH7	P40394	386 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	HIF1A	Q16665	826 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	IER5	Q5VY09	327 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	PLVAP	Q9BX97	442 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760		M0R082	166 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	PROC	P04070	461 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	NFKB1	P19838	968 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	IFT43	Q96FT9	208 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	MYO19	Q96H55	970 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	ZFAT	Q9P243	1243 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CDK1-208	ENST00000519760	MSTN	O14793	375 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	IGHA1	P01876	353 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	CCIN	Q13939	588 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	FAM229A	H3BQW9	127 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	SASH3	O75995	380 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	CHRNA4	P43681	627 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	NEUROD1	Q13562	356 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	CD163	Q86VB7	1156 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	TREML1	Q86YW5	311 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	PNMA5	Q96PV4	448 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	SCNN1A	P37088	669 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	ARSD	P51689	593 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	NUDT8	Q8WV74	236 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	NAGPA	Q9UK23	515 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	TNFRSF10B	O14763	440 aa		6.18	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	NID1	P14543	1247 aa		6.18	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	PLAUR	Q03405	335 aa		6.18	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		6.18	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
CDK1-208	ENST00000519760	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	6.18	□□□□□ -1.42	2e-6	■■□□□ 14

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