RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-377P-201ENST00000515965 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGHA2P01877 340 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDGFAP04085 211 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 MARSP56192 900 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM182BQ5T319 152 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 FOXR1Q6PIV2 292 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 XKR5Q6UX68 686 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR152Q8TDT2 470 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 RBCK1Q9BYM8 510 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 GGNBP2Q9H3C7 697 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 BRD7Q9NPI1 651 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 STRN4Q9NRL3 753 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 DCTN4Q9UJW0 460 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 BRPF3Q9ULD4 1205 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 PHF24Q9UPV7 400 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNH4Q9UQ05 1017 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNMB2Q9Y691 235 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 USP5P45974 858 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 AAMPQ13685 434 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC27Q2M243 656 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 RGL4Q8IZJ4 473 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 GJD3Q8N144 294 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 EDEM1Q92611 657 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABHD17AQ96GS6 310 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRERF1Q96PN7 1200 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 PODXL2Q9NZ53 605 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 MARK1Q9P0L2 795 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 POLIQ9UNA4 740 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDC14CA4D256 554 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 NDUFB5O43674 189 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 EPB42P16452 691 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 VEGFBP49765 207 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 CTBSQ01459 385 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 GAS6Q14393 721 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC16A10Q8TF71 515 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 ASB16Q96NS5 453 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM129BQ96TA1 746 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 GSX2Q9BZM3 304 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 EFCC1Q9HA90 598 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 USP20Q9Y2K6 914 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 ERBB4Q15303 1308 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 DCDC2BA2VCK2 349 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR25O00155 361 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 C2CD2LO14523 706 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCSK2P16519 638 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 ERCC3P19447 782 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 FGFR3P22607 806 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAPK1P28482 360 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDE3BQ13370 1112 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCINQ13939 588 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 DSC3Q14574 896 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRIN2CQ14957 1233 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 XYLBO75191 536 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAP3K6O95382 1288 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 CD33P20138 364 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 EHHADHQ08426 723 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPEM2Q0P670 501 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 LCE2CQ5TA81 110 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMC7Q7Z402 723 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 IRF7Q92985 503 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC30A3Q99726 388 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBAP1LF5GYI3 381 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 TREHO43280 583 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 TARSP26639 723 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 COL19A1Q14993 1142 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNFT1Q5M7Z0 435 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 NLRP13Q86W25 1043 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 RGS22Q8NE09 1264 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 DMRTB1Q96MA1 342 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 ELP3Q9H9T3 547 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKRD33BA6NCL7 494 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-377P-201ENST00000515965 A6NHS1 94 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR182O15218 404 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-377P-201ENST00000515965 SASH3O75995 380 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-377P-201ENST00000515965 MX2P20592 715 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRT76Q01546 638 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLCB3Q01970 1234 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-377P-201ENST00000515965 C8orf34Q49A92 452 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-377P-201ENST00000515965 TREML4Q6UXN2 200 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-377P-201ENST00000515965 TTC16Q8NEE8 873 aa4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms