RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510101.5

ADD1-215, Transcript of adducin 1, human

TSL 3

Gene ADD1, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ADD1-215	ENST00000510101	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	33.24	■■■□□ 2.91
ADD1-215	ENST00000510101	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
ADD1-215	ENST00000510101	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	33.23	■■■□□ 2.91
ADD1-215	ENST00000510101	CFAP44	Q96MT7	982 aa		33.23	■■■□□ 2.91
ADD1-215	ENST00000510101	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
ADD1-215	ENST00000510101	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		33.23	■■■□□ 2.91
ADD1-215	ENST00000510101	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ADD1-215	ENST00000510101	ALDH1B1	P30837	517 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ADD1-215	ENST00000510101	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
ADD1-215	ENST00000510101	SYNE4	Q8N205	404 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ADD1-215	ENST00000510101	MBIP	Q9NS73	344 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ADD1-215	ENST00000510101	COL4A5	P29400	1685 aa		33.21	■■■□□ 2.91
ADD1-215	ENST00000510101	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		33.21	■■■□□ 2.91
ADD1-215	ENST00000510101	PARP10	Q53GL7	1025 aa		33.2	■■■□□ 2.91
ADD1-215	ENST00000510101	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		33.19	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	NLRP10	Q86W26	655 aa		33.19	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		33.18	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	HOXB7	P09629	217 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	TCIRG1	Q13488	830 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	POTEI	P0CG38	1075 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	POTEJ	P0CG39	1038 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	LAMB2	P55268	1798 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	ZNF428	Q96B54	188 aa		33.14	■■■□□ 2.9
ADD1-215	ENST00000510101	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	PSMD1	Q99460	953 aa		33.13	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	FZD9	O00144	591 aa		33.11	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	IFT57	Q9NWB7	429 aa		33.11	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		33.09	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	NLRP3	Q96P20	1036 aa		33.09	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		33.09	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	TAF1	P21675	1872 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ADD1-215	ENST00000510101	ABCC4	O15439	1325 aa		33.07	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		33.07	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		33.07	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	COL4A1	P02462	1669 aa		33.06	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	SCN4A	P35499	1836 aa		33.05	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	PCNT	O95613	3336 aa		33.05	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	GNAI1	P63096	354 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	KLRG1	Q96E93	195 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	HYPK	Q9NX55	129 aa		33.03	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		33.03	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	TSPYL6	Q8N831	410 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		33.01	■■■□□ 2.88
ADD1-215	ENST00000510101	LTBP1	Q14766	1721 aa		33.01	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	CHADL	Q6NUI6	762 aa		33	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	JMY	Q8N9B5	988 aa		33	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	FAM89A	Q96GI7	184 aa		32.99	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	BBOX1	O75936	387 aa		32.95	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.95	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	SP8	Q8IXZ3	490 aa		32.95	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	GPC2	Q8N158	579 aa		32.95	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
ADD1-215	ENST00000510101	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		32.95	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.94	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	JDP2	Q8WYK2	163 aa		32.94	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	PASK	Q96RG2	1323 aa		32.94	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	GRAP	Q13588	217 aa		32.93	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	AOC3	Q16853	763 aa		32.93	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	LDHD	Q86WU2	507 aa		32.93	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		32.93	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	HACL1	Q9UJ83	578 aa		32.93	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		32.92	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	EPHX2	P34913	555 aa		32.92	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	SCNN1D	P51172	638 aa		32.91	■■■□□ 2.86
ADD1-215	ENST00000510101	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms